Успех советских спецслужб по проникновению в структуры западных разведок и органы безопасности являлся не только отрезвляющим фактором для руководителей американской контрразведки, но и постоянно заставлял совершенствовать методы контрразведывательной деятельности. По рекомендации безусловного авторитета в среде спецслужб Энглтона руководство ЦРУ постоянно настаивало на тесной координации контрразведывательной деятельности всех служб, входящих в Разведывательное сообщество США. Естественно, в силу функциональных обязанностей и согласно законодательству координирующая роль в этой деятельности принадлежала и продолжает принадлежать Федеральному бюро расследований, по рекомендации которого президентская администрация США периодически обновляет так называемые перечни особо важных угроз, касающихся в том числе военной сферы, для противодействия которым обязывает соответствующие спецслужбы страны объединять свои усилия.
Однако излишнее усердие контрразведчиков, как впоследствии было определено в ходе расследований по результатам работы спецслужб, зачастую препятствовало элитному сегменту Разведсообщества — разведчикам выполнять их прямые обязанности. Например, между ЦРУ и РУМО неоднократно возникали конфликты в связи с тем, что Энглтон и его сотрудники постоянно вмешивались в специфическую вербовочную работу военных разведчиков, подозревали завербованных агентов и перебежчиков в работе на врага и тем самым срывали перспективные операции. Параллельно же контрразведчики ЦРУ и сотрудники военной контрразведки продолжали расширять сети своей агентуры в США, активизируя борьбу с внутренним врагом, что в очередной раз являлось свидетельством прямого нарушения американского законодательства. В результате нескольких сенатских расследований начала и середины 70-х годов (комиссии Мерфи, Черча и др.) законодателями вновь были приняты законы и подзаконные акты, ограничивавшие деятельность спецслужб, главным образом в отношении американских граждан на территории США. Жестким репрессиям были подвергнуты и руководители контрразведывательных органов. Решением директора Центральной разведки Уильяма Колби в декабре 1974 года Дж. Энглтон и вся его команда были отправлены в отставку. Определенным, но менее жестким репрессиям подверглись и сотрудники других контрразведывательных служб, включая военную контрразведку.
Однако формулирование стратегии контрразведывательной деятельности в США и, соответственно, главная роль в этой сфере все же продолжали принадлежать ФБР. Директор бюро Джон Эдгар Гувер с санкции президентской администрации еще в 1956 году предложил руководству страны так называемую контрразведывательную программу, к реализации которой под патронажем ФБР были привлечены соответствующие структуры всех членов Разведывательного сообщества США, включая военную контрразведку.
