С другой стороны, в силу сложившейся за долгие годы развития американских вооруженных сил так называемой децентрализованной системы военного руководства в Вашингтоне полагали, что основные вложения, как материальные, так и людские, следует концентрировать не в центре, а, что называется, на местах. В связи с этим сразу после вступления в войну американским военно-политическим руководством были предприняты экстренные меры по усилению разведывательных (отделов и управлений — G-2) и аффилированных с ними контрразведывательных служб в штабах стратегических группировок войск на театрах войны: Европейском (и связанном с ним стратегически Североафриканском) и в тихоокеанской зоне. При этом решению организационных вопросов и деятельности контрразведки придавалось более весомое значение, чем это было в годы Первой мировой войны. Так, например, с целью повышения статуса и, соответственно, значимости этой службы уже через неделю после вступления США в войну пребывавший в полуактивном состоянии Корпус разведывательной полиции был преобразован в Корпус контрразведки с новым значительно расширенным штатом — 543 офицера и 4431 служащий [19].
На территории США сотрудники корпуса во взаимодействии с военной полицией и ФБР незамедлительно приступили к выполнению задач по проверке военного персонала, имеющего доступ к информационным материалам ограниченного пользования, расследованию случаев саботажа, заговоров и диверсий на военных объектах и предприятиях оборонного комплекса, проявлений нелояльности, особенно направленных против американских военнослужащих со стороны лиц немецкого, а также итальянского и особенно японского происхождения. В соответствии с так называемым президентским чрезвычайным указом № 9066 от 19 февраля 1942 года военной контрразведке во взаимодействии с ФБР было предоставлено право «подвергать перемещению в зоны выселения» лиц «нелояльной национальности». Реально интернированию были подвергнуты в основном японцы, как американские граждане, так и те, кто не успел выехать за пределы США. В течение двенадцати месяцев, начиная с марта 1942 года, в семи штатах было открыто десять концентрационных лагерей, в которых содержалось более 120 тыс. японцев [23].
Военные контрразведчики на территории США в годы войны развернули активную деятельность, периодически выходившую за рамки даже законов военного времени. Отмечались неоднократные случаи вмешательства военных контрразведчиков в дела, военный аспект которых был явно второстепенным либо вообще надуманным, в связи с чем американским законодателям пришлось вмешаться и весьма существенно ограничить деятельность данной службы на территории США. Однако для военных контрразведчиков нашлось новое и, пожалуй, главное до окончания войны применение, связанное с реализацией так называемого Манхэттенского проекта по созданию ядерного оружия. Проявленные военной контрразведкой во взаимодействии с ФБР поистине титанические усилия на данном поприще тем не менее давали сбои, в результате чего имели место постоянные утечки информации, способствовавшие успеху ядерного проекта в СССР.
