Группа делегатов съезда создала «военную оппозицию», выступившей против линии ЦК партии в военном строительстве. Она выступала за выборность командного состава, против установления строгой дисциплины, использования царских военных специалистов. Ее активными представителями были В.М. Смирнов, Г.И. Сафаров, Ю.Л. Пятаков.
На съезде Ленин призвал к совершенствованию Красной Армии и ее вооружения. Он говорил 18 марта: «Без вооруженной защиты социалистической республики мы существовать не могли. Господствующий класс никогда не отдаст своей власти классу угнетенному. Но последний должен доказать на деле, что он не только способен свергнуть эксплуататоров, но и организоваться для самозащиты, поставить на карту все… Это значит, что господствующий класс, пролетариат, если только он хочет и будет господствовать, должен доказать это и своей военной организацией». Ленин заявил, что «теперь на первом плане должна быть регулярная армия, надо перейти к регулярной армии с военными специалистами». Он осудил действия Сталина в Царицыне, в частности казни офицеров, и выразил особое возмущение ставленником Сталина Ворошиловым, который развел на фронте «старую партизанщину».
В резолюции съезда было отмечено, что «в партию широкой волной приливают элементы, недостаточно коммунистические и даже прямо примазывавшиеся. РКП стоит у власти, и это неизбежно притягивает к ней, наряду с лучшими элементами, и элементы карьеристские… Необходима серьезная чистка и в советских, и в партийных организациях». В новой программе партии в дружелюбных словах было сказано о зарубежных специалистах, работающих «рука об руку с массой рядовых рабочих, руководимых сознательными коммунистами».
Первое заседание Политбюро состоялось 16 апреля 1919 года. На нем присутствовали всего лишь четверо — Ленин, Каменев, Крестинский и Калинин. Рассматривали, главным образом, вопрос об улучшении экономического положения московских рабочих. Поговорили также о возможности преподавания Закона Божия в школах во внеурочное время, о пополнении коллегии Наркомата земледелия, о поездке Калинина на агитпоезде «Октябрьская революция»…
На Московско-Казанской железной дороге 10 мая 1919 года состоялся первый массовый коммунистический субботник, в котором участвовало около 250 человек. Эта затея руководителям партии понравилась, и в последующие годы проведение субботников распространили на всю страну.
В здании Московского комитета РКП(б) в Леонтьевском переулке (двухэтажный особняк графини Уваровой) 25 сентября 1919 года взорвалась бомба, брошенная анархистом, в результате чего погиб секретарь МК РКП(б) Владимир Михайлович Загорский и еще 11 партийных работников, 55 человек получили ранения. Их похоронил на Красной площади.
