Однако дни пребывания «Учебника» и его соседей на полках библиотеки были сочтены. В 1534 году Акт о супрематии сделал Генриха VIII главой англиканской церкви, обозначив формальное отделение власти Папы от религиозной жизни Англии и Уэльса. С этого момента начался формальный роспуск монастырей, достигший значительных масштабов после 1536 года с принятием Акта о суде приумножений (создавшего механизм для управления бывшей монастырской собственностью) и Акта о роспуске малых монастырей. После короткой передышки, когда некоторые из более крупных аббатств предположили, что им удастся избежать той же судьбы, план Томаса Кромвеля заработал на полную мощность, и в 1539 году был принят Акт от роспуске больших монастырей, что позволило подвергнуть инспекции оставшиеся организации подобного рода, после чего те были вынуждены подчиниться, добровольно или силой. Одним из таких «больших монастырей» был Гластонбери, которому предстояло стать местом одного из последних и самых жестоких событий английской Реформации.
В течение лета 1539 года, если судить по уцелевшим финансовым документам аббатства, это крупное сообщество, по-прежнему руководимое семидесятилетним аббатом , продолжало жить в естественном ритме, как и многие века до того: покупалась еда для трапезной, поддерживалась в порядке территория и очищались источники воды [12]. Возможно, Уайтинг считал, что его аббатство могут пощадить благодаря его дружбе с Леландом, а также тому, что он не препятствовал Реформации в парламенте (где заседал в палате лордов), и подписал, как и многие его коллеги-аббаты, клятву о принятии верховенства короля. Но Гластонбери славилось своим богатством, а король отличался непомерным аппетитом к увеличению собственного состояния. В сентябре 1539 года Кромвель послал в аббатство уполномоченных, распространив обвинения, будто Уайтинг «не признает ни Господа, ни принца его, ни религии христианской». 19 сентября он был допрошен в своем доме в Шарпхэм-парке, где уполномоченные объявили о найденных доказательствах его «порочной и предательской души». Но когда Уайтинг отказался добровольно отдать аббатство, уполномоченные провели обыск и «нашли» изобличающие документы, осуждающие королевский развод, а также спрятанные деньги. Больше им ничего не требовалось. 14 ноября 1539 года Уайтинг был предан суду в соседнем городке Уэллс, где в качестве главного обвинения против него было выдвинуто «ограбление церкви Гластонбери». На следующий день его проволокли по улицам, а затем отправили на холм Гластонбери-Тор, где он «попросил милосердия у Бога и короля за свои великие прегрешения» и был повешен. Его тело разрубили на части, одну из которых отправили на всеобщее обозрение в Уэллс, другую в Бат, а остальное в Илчестер и Бриджуотер. Голову его выставили на воротах аббатства в самом Гластонбери.
