В 1821 г. казахи Старшего жуза восстали против кокандцев и вернули казахские города Чимкент и Сайрам.
В 1829 г. кокандский хан Мухаммед-Али (1822–1842) совершил военный поход на Кашгар, где восстало мусульманское население против Китая. С приближением значительных китайских сил, Мухаммед-Али покинул Кашгар. С ним ушли в Фергану 70 тыс. кашгарских мусульман, большая их часть была поселена в окрестностях и городе Шахрихане. Когда наладились кокандско-китайские отношения, часть кашгарцев вернулась в Кашгар[78].
Кокандцам удалось подчинить себе таджиков Каратегина, живших в горах на юге Алайского хребта. Таджики Дарваза, Шугнана, Вахана и Рошана номинально подчинялись Кокандскому ханству.
Бухарскому эмиру удалось подчинить Кокандское ханство, признавшего вассальную зависимость, и уступить Ходжент. В 1842 г. в Кокандском ханстве поднялось антифеодальное восстание. Бухарский эмир Насрулла жестоко подавил восставших и занял Коканд, кокандский хан был убит. Эмир заявил о присоединении Кокандского ханства к Бухарскому эмирату. Затем эмир занял Ташкент.
Но летом 1842 г. в Бухарском эмирате вспыхнуло восстание кокандцев и эмир Насрулла был свергнут с престола. Причиной восстания были непомерные налоги со стороны бухарского наместника. Кокандцы вместе с казахами-кипчаками Ферганы провозгласили ханом казахского султана Ширали, кочевавшего на Таласе. Опираясь на казахов-кипчаков и узбекские племена, хан Ширали двинулся на Коканд. Бухарский наместник в Коканде бежал; бухарский военный гарнизон и чиновники были перебиты восставшими. Хан Ширали начал строить оборонительные стены вокруг г. Коканда. Бухарский эмир Насрулла пытался штурмом взять Коканд, но все его попытки закончились неудачей.
В этот момент хивинский хан Аллакуль напал на г. Бухару. Бухарский эмир спешно вернулся обратно.
Вскоре после этого горожане г. Ходжента изъявили желание о возвращении под юрисдикцию Кокандского ханства. Кокандцы взяли Ташкент. Кокандское ханство восстановилось в границах, которые сложились при Омар-хане[79].
В Хивинском ханстве также шла борьба за объединение всех областей Хорезма. Хивинский хан Мухаммед-Рахим I (1806–1825) постепенно подчинил себе небольшие самостоятельные владения. После упорного сопротивления в 1811 г. было покорено Аральское владение, город Кунград был разрушен. Каракалпаки имели самостоятельное владение на северо-востоке от Хивинского ханства.
В 1818 г. в походе на Хорасан Мухаммед-Рахим, пытался склонить к совместным действиям туркмен-гокленов и теке. За отказ участвовать в военных действиях он напал на туркмен, разорил их, многих взял в плен, ввел тяжелые подати, отобрал пахотные земли и присоединил их к своим владениям.
