В ходе выборов должно было быть избрано 450 депутатов на два года. Половина мест распределялась по пропорциональной системе между партиями в зависимости от количества голосов, поданных избирателями за их партийные списки. Другая половина избиралась по мажоритарной системе, что означало избрание от каждого округа одного кандидата, набравшего наибольшее число голосов. Кроме того, в Совет Федерации избирались по два представителя от каждого субъекта Федерации. В ходе избирательной кампании определились ведущие партии и блоки. На правом фланге были блок «Выбор России» под руководством первого вице-премьера Е. Гайдара, А. Чубайса, А. Козырева (в первую Госдуму было разрешено избираться членам правительства), блок «Яблоко», названный по фамилиям лидеров Г. Явлинского, Ю. Болдырева, В. Лукина (Болдырев впоследствии вышел из организации по причине несогласия с прозападной политикой Явлинского), «Партия российского единства и согласия» под началом С. Шахрая и А. Шохина. В районе центра заняли позиции Демократическая партия России Н. Травкина и движение «Женщины России» А. Федуловой. Наконец, на левом фланге помимо КПРФ была Агарная партия М. Лапшина. Кроме того, выделялась Либерально-демократическая партия России В. Жириновского, развернувшего оголтелую националистическо-популистскую пропаганду, пользуясь платным временем в телевизионном эфире.
Компартия была лишена финансовых средств и других возможностей провести полноценную избирательную кампанию, что при развертывании мощной антикоммунистической информационной кампании в прессе и на ТВ сказалось на результатах. КПРФ получила 12,4 % голосов, что вместе с одномандатными округами дало 45 мест в Государственной Думе. Это была третья фракция по численности, причем мандатов было вдвое больше, чем предполагал Зюганов. Союзник КПРФ Аграрная партия получила 7,9 %, а всего 55 мест. Далее, ЛДПР — заработала 22,8 % и 64 места. «Выбор России» — 15,4 % и 76 мест, «Женщины России» — 7,9 % и 23 места, «Яблоко» — 7,8 % и 29 мест. «Пресс» получила 31 место, ДПР — 15 мест, но по партийным спискам не прошла. В Думе были образованы за счет независимых депутатов группы «Новая региональная политика» В. Медведева — 60 мест, «Российский путь» С. Бабурина — 13 мест.
Общее соотношение оказалось не в пользу либералов, партии коммунистической и националистической ориентации могли в случае совместных (как показала практика, очень редких) действий набрать 40 %, центристы составляли 30 % и либералы чуть больше 30 %. Хотя объективно крупней была фракция «Выбор России», принято считать, что победителем первых выборов стала ЛДПР Жириновского, 22,8 % которой стало настоящей сенсацией, потрясшей российскую общественность.
