Советские органы безопасности приняли меры по пресечению диверсионных актов в приграничных районах, выяснению причин прибытия подозрительных лиц в местах расположения объектов, представлявших интерес для нацистской разведки, активизировали ведение разведки и приняли другие меры.
При вхождении прибалтийских стран в состав Советского Союза в условиях активизации иностранных разведок и антисоветских организаций одновременно с вводом войск на их территории активно действовали оперативные группы НКВД. Они захватили архивы разведывательных и полицейских органов, арестовали крупных чиновников аппарата управления, предотвратили грабежи и в интересах контрразведывательных органов получили сведения об агентуре, работавшей по иностранным государствам. Еще 4 декабря 1939 г. Политбюро ЦК ВКП (б) возложило на НКВД СССР реализацию решения о выселении всех проживавших в Западной Украине и Западной Белоруссии осадников вместе с их семьями. Такого рода меры исходили из того, что «Союз осадников» был создан после окончании советско-польской войны 1920 г. специальным законом польского правительства, утвержденного сеймом, и рассматривался как военно-политическая опора властей и пограничной стражи в отошедших к Польше украинских и белорусских областях. Целью насаждения осадников являлось укрепление пограничной полосы преданными государству элементами, создание боевых дружин для борьбы с революционным движением украинцев и белорусов, связанных с СССР. Осадники наделялись лучшими землями, и им предоставлялся ряд льгот. Они могли стать опорой и создаваемого подпольного движения, а также привлекаться для проведения диверсионно-террористической деятельности и шпионажа.
16 мая 1941 г. был подготовлен проект постановления ЦК ВКП (б) и СНК СССР «О мероприятиях по очистке Литовской, Латвийской и Эстонской ССР от антисоветского, уголовного и социально опасного элемента», по которому предполагалось привлечение к уголовной ответственности и выселение «активных членов контрреволюционных партий и участников антисоветских националистических организаций»[60]. Поэтому органами НКВД СССР из прибалтийских республик в районы Красноярского края, Новосибирской, Омской и Кировской областей были административно высланы 38 928 человек: «бывших людей», семьи националистов, различный антисоветский элемент. За два дня до начала войны, в 2 часа ночи, была проведена операция во всех западных областях Белорусской ССР. К 6 часов утра арестован 501, выселены 2425 человек.
