Гибко реагируя на изменение общего курса, Фонд уделял теперь особе внимание «социальной медицине». В отчётах, подготовленных в экспертных группах при участии экспертов Фонда, содержались рекомендации о необходимости внедрения комплексных подходов к социальному обеспечению, а не узкого фокусирования на клинической помощи, поднимался вопрос и об антагонизме между профилактической и лечебной медициной. Под воздействием установок ВОЗ Фонд способствовал устранению давнего разделения между «медициной» и «общественным здравоохранением», поддержав, в частности несколько медицинских «школ здоровья» в Колумбии, которые в 60-х годах послужили основой для призыва ВОЗ к преподаванию общинной, профилактической, социальной и профессиональной медицины как части международных признанных стандартов. Во многом эта тактика определялась соперничеством с СССР, оказывающим активную помощь в создании системы общественного здравоохранения в других странах.
Особо важной проблемой для Фонда стало сохранение за собой ведущей роли в программе стипендий и в первую очередь в тех важных областях, которые не представляли основного интереса для ВОЗ. Он дал понять, что ВОЗ должна воздерживаться от «переманивания» стипендиатов, подготовленных для проектов Фонда. Фактически он обвинил организацию в кадровом рейдерстве, что настолько встревожило генерального директора Д. Б. Чисхольма, что тот попросил у Фонда разрешения использовать его каталог стипендий для набора кандидатов для полевых проектов.
Что касается финансирования проектов ВОЗ, то Фонд никогда не делал этого, если не участвовал в их разработке, при этом стремился воспользоваться демонстрационными проектами для организации конкретных исследований. Когда в 1953-54 гг. ВОЗ столкнулась с финансовыми трудностями из-за недостаточных выплат США и была вынуждена заморозить свои расходы (не хватало 30 млн долл.), сотрудники Фонда по-наставнически поучали их техническим тонкостям. Действительно, обеспокоенность по поводу ослабления финансовой поддержки ВОЗ со стороны американского правительства была настолько велика, что её консультанты неоднократно обращалась к Фонду за помощью.
В 1953 г. при подготовке Национальной конференции по всемирному здравоохранению председатель американского Национального комитета по всемирному здравоохранению Ф. Будро был вынужден даже пригласить на неё лично Нельсона Рокфеллера для привлечения интереса к проблемам мирового здоровья и укрепления авторитета ВОЗ в глазах американской общественности.
