Спокойную жизнь семьи нарушил отец: он разошелся с Уммугульсум и женился на одной эстрадной певице. Мулланур остро пережил разлад в семье. Он ушел от отца к матери.
Муллазян, сильно любивший сына, изредка помогал Муллануру и его матери, но жизнь все равно была не из легких. Приходилось экономить на всем. Несправедливость жизни угнетает Мулланура. Он много читает, ищет в книгах правду и справедливость.
Большое влияние на развитие самосознания Мулланура оказала первая русская революция. Учащиеся Казанского реального училища были взбудоражены революционными событиями. Мулланур знакомится с членами подпольной организации большевиков. Он впервые слышит о марксистском учении. И. Кулиев в своих воспоминаниях пишет: «Мы всегда собирались у Мулланура под видом чаепития, а на самом деле занимались чтением запретной литературы. Он уже тогда поражал нас своей начитанностью и умением логично и дальновидно рассуждать».
Мать Мулланура прекрасно понимала, что сын занимается «недозволенными» делами, но не останавливала его. Наоборот, она помогала Муллануру. Уммугульсум во время полицейских налетов прятала товарищей Мулланура, сохраняла запрещенную литературу.
Мулланур видел, как жестоко царские власти подавляли революционное движение в Казани. В этом им активно помогали купцы, муллы, фабриканты. И раньше тяжелое экономическое положение татар-трудящихся после подавления революции еще ухудшилось.
В 1907 году, после окончания курса Казанского реального училища, Мулланур поступает в Петербургский политехнический институт на экономическое отделение. Здесь он знакомится с революционной молодежью столицы, принимает активное участие в студенческих сходках.
В 1910 году Мулланур Вахитов был исключен из политехнического института якобы за «невзнос платы за обучение». В те годы царские власти с особенным усердием исключали из высших учебных заведений революционно настроенных студентов. и «невзнос платы за обучение» часто служил лишь формальным предлогом для исключения.
Мулланур Вахитов стремился получить высшее образование. Он снова сдал конкурсные экзамены и вновь поступил на первый курс политехнического института. Но в мае 1911 года его вынуждают покинуть этот институт. Тогда он сдает вступительные экзамены в психоневрологический институт и, несмотря ни на что, продолжает учебу.
Мулланур Вахитов постоянно интересовался жизнью и бытом татаро-башкирского населения Прикамья. Вот что рассказывает об этом Лукман Антов (ветеран гражданской войны, артист татарского театра, ныне пенсионер) в своих воспоминаниях:
