Конституция отнесла к ведению Жогорку Кенеша внесение изменений и дополнений в Конституцию. Кстати отметим, что правом вносить изменения и дополнения в Конституцию кыргызский парламент был наделен и Конституцией в редакциях 1993, 1996 и 1998 гг. Однако после 1993 г. он фактически был устранен от участия в конституционном процессе, все изменения и дополнения в Конституцию вносились по итогам референдумов, назначаемых Президентом. В новой редакции Конституции, также принятой по итогам референдума 2003 г., установлено, что ведущая роль во внесении изменений и дополнений в Конституцию тоже принадлежит Президенту. Так, изменения и дополнения в Конституцию принимаются на референдуме, проведение которого назначается Президентом.
Изменения и дополнения могут приниматься Жогорку Кенешем – по предложению либо Президента, либо большинства от общего числа депутатов, либо по инициативе не менее 300 тыс. избирателей. Предложения о внесении изменений и дополнений рассматриваются Жогорку Кенешем с учетом заключения Конституционного суда и принимаются, если за них проголосовало не менее двух третей от общего числа депутатов. Естественно, Закон о внесении изменений и дополнений в Конституцию подлежит подписанию Президентом, который может возвратить его для дополнительного рассмотрения со своими замечаниями. К ведению Жогорку Кенеша отнесено толкование Конституции и принятых им законов.
К ведению Жогорку Кенеша относятся также изменение границ Кыргызской Республики, утверждение республиканского бюджета и отчета о его исполнении, общегосударственных программ социально-экономического развития, внесенных Правительством, решение вопросов административно-территориального устройства страны, назначение выборов Президента, отрешение его от должности.
Новая редакция Конституции по сравнению с Конституцией в редакции 1996 г. значительно расширила полномочия Жогорку Кенеша во взаимоотношениях с Правительством. К его ведению относятся: утверждение по представлению Президента структуры Правительства, дача согласия на назначение Премьер-министра и членов Правительства, заслушивание ежегодных отчетов Премьер-министра, выражение в случаях, предусмотренных Конституцией, большинством не менее двух третей депутатов недоверия Правительству. По Конституции в редакции 1996 г. структуру Правительства определял Президент самолично, членов Правительства и руководителей административных органов он назначал после консультации с Премьер-министром. Жогорку Кенеш не принимал участия в этих процедурах.
