В 1902 году на месте погребения блаженной Ксении была сооружена новая каменная часовня с иконостасом из мрамора и надгробием в центре. Годом позднее на Васильевском острове был учрежден Епархиальный дом трудолюбия для бедных женщин духовного звания в память рабы Божией Ксении, в котором не имеющим заработка женщинам и девушкам православного вероисповедания обеспечивали врачебную помощь, содержание, предоставляли швейные машины и все, что было необходимо для работы. В наши дни имя Ксении носит церковная больница при петербургской Духовной академии и семинарии.
В советский период часовня была закрыта постановлением Ленинградского горисполкома. Во время Великой Отечественной войны в ней был устроен тарный склад. В 1946 году многочисленные просьбы верующих заставили городские власти уступить и открыть часовню, однако в 1960 году ее снова закрыли. Более того, могила блаженной Ксении была замурована, над ней соорудили постамент, и после этого в часовне открыли мастерскую по изготовлению кожаной обуви. Однако из этой затеи ничего толкового не получилось. Сапожникам не удавалось вбить ни одного гвоздика, так их трясло на постаменте.
Тогда было решено устроить в часовне мастерскую по производству скульптур для парков, типа атлетического вида девушек с веслом. И опять не сложилось. Сколько бы они ни изготавливали фигур в течение дня и как бы ни запирали мастерскую, придя утром, ваятели зачастую обнаруживали в мастерской одни обломки.
Потом часовню заколотили, и длительное время она пребывала в состоянии полной запущенности, обнесенная сплошным забором из досок. Но паломники со всех концов страны стремились к блаженной Ксении со своими бедами и надеждами.
Бытует и такое мнение, что уберегло часовню от закрытия на веки вечные и даже от сноса невольное «покровительство» советского министра и коммунистического деятеля А. Н. Косыгина. Его родители покоятся на Смоленском кладбище, и он довольно часто наведывался на их могилы, что якобы обеспечивало этому месту защиту властей. Но, конечно, спасение было вовсе не в этом.
Восторжествовала же справедливость в 1984 году, когда часовня блаженной Ксении Петербургской была передана общине храма во имя Смоленской иконы Божией Матери. Часовню восстанавливали сообща верные и верующие люди, и в 1987 году состоялось ее повторное освящение. А в следующем году на Поместном соборе Русской православной церкви, который был посвящен тысячелетию крещения Руси, великая русская подвижница XVIII столетия была причислена к лику Божьих угодников, иначе говоря канонизирована. Прославление ее — событие знаменательнейшее, потому что женщин не причисляли к святым в Русской Церкви практически с XVI века, а в лике святых, чья память празднуется православной церковью, имя юродивой Христа ради появилось снова после шестнадцати веков (до нашего времени первой и единственной была Исидора Тавеннийская, жившая в IV веке монахиня-подвижница).
