Генеральный уряд был центральным органом управления. Он возглавлял всю систему управления и был постоянно действующим органом.
Генеральный уряд избирался Войсковой радой. Возглавлял Генеральный уряд гетман: как глава государства, высший судья и верховный главнокомандующий, законодатель, поскольку он выдавал универсалы — нормативные акты, обязательные для выполнения на всей территории Украины.
Генеральный уряд был высшим распорядительным, исполнительным и судебным органом государства. Кроме гетмана в Генеральный уряд входили генеральные старшины, которые руководили отдельными отраслями управления.
Ближайшим к гетману государственным лицом был генеральный писарь. Он руководил внешними сношениями и канцелярией, через которую проходили все документы как к гетману, так и от него.
Генеральный обозный, генеральный есаул и генеральный хорунжий занимались военными делами, отвечали за боеспособность войска и его материальное обеспечение.
Генеральный бунчужный охранял знаки достоинства гетмана и Войска Запорожского, а также выполнял отдельные поручения гетмана.
Генеральный судья был высшей апелляционной инстанцией по отношению к полковым и сотенным судам.
Генеральный подскарбий возглавлял финансовую систему государства.
Перечисленные государственные лица составляли Раду генеральной старшины, которая со временем вытесняет Войсковую раду.
Местное управление осуществляли полковые и сотенные уряды, а также выборные лица в городах и селах.
Полковой уряд состоял из полковника и полковой рады, которая избирала полковую и сотенную старшину. Часто полковники узурпировали в своих руках всю власть на местах и игнорировали полковые рады, а иногда, наоборот, полковые рады активно влияли на деятельность полковников, препятствовали их своеволию и даже устраняли их от должности. В полковую раду входили обозный, писарь, судья, есаул и хорунжий. По такому же принципу строилась сотенная администрация. Сотенный уряд возглавлял сотник. Ему помогала сотенная администрация: есаул, писарь и хорунжий. Судебные функции в сотне выполнял городовой атаман.
Города имели свою администрацию, ее власть не распространялась на казаков. В селах войты управляли крестьянами, а атаманы казаками. Не сохранилось никаких законодательных актов, по которым можно было бы установить функции этих органов управления. В основу их деятельности, следует полагать, были положены традиции и обычное право.
Налоги и финансы. Для удержания аппарата власти и управления нужны были средства. С этой целью проводился сбор налогов. Они собирались с крестьян и городских жителей. Казаки от налогов освобождались, что было их старой привилегией.
