В окрестностях Джулека в Перовском уезде Сырдарьинской области он собирает большую коллекцию членистоногих, изучает вопрос заболеваемости малярией. «Джулек, — пишет Павловский в одной из своих статей, — вероятно, персидское слово. В переводе оно означает «тысяча источников». Часть из них я разыскал и осмотрел попутно бывшую крепость, основанную в 1861 году. Малярия в районе Джулека в ту пору была распространенной болезнью. Против нее не принималось никаких мер. Правда, на воздухе жители спали под пологами, но в таких случаях имелась в виду защита от комаров вообще, но не от малярийных в частности. Предохранительной хинизации здесь не существовало. Хиной пользовались лишь тогда, когда появлялись приступы болезни. Хина, как и другие лекарства, здесь была дорогой. Все это в связи с отсутствием врачебной помощи и ознакомления населения с причинами болезни являлось неблагоприятным обстоятельством, немало содействовавшим развитию болезни. Были места еще худшие, как, например, Джизак или местность в Голодной степи, где явных маляриков среди населения имелось свыше 50 процентов».
Миновали годы. В результате больших трудов целой армии маляриологов болезнь была полностью ликвидирована.
В 1921 году, после кончины профессора Н. А. Холодковского, кафедру зоологии и сравнительной анатомии Военно-медицинской академии возглавил Е. Н. Павловский.
П. П. Перфильев, один из первых учеников Е. Н. Павловского, вспоминает слова учителя, сказанные им в дружеской беседе:
— Когда я пришел на кафедру как только что назначенный ее начальник, первой моей мыслью было горячее желание подготовить собственных учеников, а в дальнейшем попытаться создать из них школу. Да, да, именно школу. Паразитология в наши дни — это не то, что прежде. Она становится чрезвычайно важной и нужной наукой. А школа — это не самоцель, а боевой штаб, организующий настойчивую борьбу с болезнями.
Осуществляя задуманное, Павловский организует серию экспедиций на далекие окраины Советского Союза. В экспедиции он включает слушателей старших курсов, привлекает молодежь на местах, приглашает для работы местных врачей и биологов.
На стенах его кабинета появляются географические карты с прочерченными цветными маршрутными линиями. Ученый публикует статьи, печатает инструкции, брошюры, научные сборники.
Каждый успех, достигнутый специалистами, пусть и не входящими в круг его сотрудников, Павловский воспринимает с восторгом. Так, в 1931 году к нему приезжает из Самарканда профессор Л. М. Исаев. На пороге кабинета он попадает в дружеские объятия Евгения Никаноровича. Под руководством Исаева большая группа энтузиастов полностью ликвидировала единственный в Советском Союзе очаг дракункулеза. Возбудитель заболевания ришта — червь, вызывавший неподвижность суставов, гнойное воспаление, тяжкие страдания.
