Новое поколение российских военных контрразведчиков показало себя не только профессионалами высочайшего уровня, способными обеспечить сохранность важнейших секретов, а людьми долга и чести. Как и в годы Великой Отечественной войны, они плечом к плечу с армейскими товарищами сражались с общим врагом — террористами и бандитами. В трудную минуту, когда гибли командиры подразделений, контрразведчики брали на себя командование, организовывали оборону и контратаки, вступали в рукопашные схватки.
11 января 2000 года старший оперуполномоченный капитан Игорь Яцков, выполняя специальное задание, в составе разведдозора 136-й отдельной мотострелковой бригады в районе населенного пункта Кири Чеченской Республики попал в засаду боевиков. После гибели командира он, организовав оборону, приказал части личного состава отойти, а сам с оставшимися бойцами прикрывал их отход. В ходе боя Яцков получил тяжелые ранения, но не оставил позицию, отстреливался до последнего патрона и погиб.
Указом Президента Российской Федерации от 19 февраля 2000 года за мужество и героизм, проявленные при исполнении служебного и воинского долга, капитану Яцкову Игорю Владимировичу было посмертно присвоено звание Героя Российской Федерации.
Этой высокой чести удостоились еще четверо военных контрразведчиков: адмирал Угрюмов Герман Алексеевич, генерал-лейтенант Хоперсков Григорий Константинович, генерал-лейтенант Дуканов Олег Михайлович и капитан Громов Сергей Сергеевич (посмертно).
Наряду с участием в боях военные контрразведчики занимались операциями, связанными с освобождением из плена российских и иностранных граждан. За один только 2000 год им, членам Комиссии при Президенте Российской Федерации по военнопленным, интернированным и пропавшим без вести, а также сотрудникам территориальных органов безопасности удалось вырвать из лап бандитов и террористов 78 военнослужащих и 22 гражданских лица.
Важное место в деятельности военных контрразведчиков занимала полная смертельного риска разведывательная работа в среде незаконных военных формирований. Временной оперативной группой (ВОГ) Управления военной контрразведки ФСБ России в Северо-Кавказском регионе только за 1999–2000 годы было выявлено 57 баз боевиков, 6 укрепрайонов, 65 блиндажей, около 60 укрытий и 230 схронов и тайников с оружием. В ходе последующих войсковых операций значительная их часть была уничтожена. Через надежные оперативные источники в незаконных военных формированиях были выявлены и затем перекрыты каналы финансирования и переправки наемников через государственную границу.
