После присоединения Португалии к испанцам перешли и все ее колонии: острова Мадера, Азорские и Зеленого Мыса, значительная часть Гвинеи, Конго, Ангола и мыс Доброй Надежды в Африке. В Азии Испания получила все юго-западное побережье, и, в частности, побережье залива Оман, часть Красного моря, Индостан, Цейлон, полуостров Малакку, острова Борнео, Суматру, Целебес, Молуккский архипелаг и многочисленные фактории в Китае и Японии. Азиатские владения были разделены на три вицекоролевства.
Наследный принц дон Карлос. Филипп II имел от своей первой жены — принцессы Марии Португальской — сына Карлоса (1545 г.), предполагаемого наследника испанского престола. За свою короткую жизнь (23 года) Карлос причинил Филиппу, пожалуй, больше огорчений, чем все его политические неудачи вместе взятые. Кроме того, судьба Карлоса дала повод к созданию очень распространенных, не благоприятных для Филиппа легенд.
Карлос родился очень слабым и хилым ребенком. С малых лет в нем обнаружились раздражительный и тяжелый характер и полная непригодность к умственным занятиям. Это было настолько заметно, что король еще в 1550 г. стал задумываться над тем, сможет ли Карлос стать достойным наследником престола. Тем не менее в 1560 г. кастильские кортесы признали его права. Европейские дворы начали вести переговоры о будущем браке Карлоса. Во Франции намеревались женить его сначала на принцессе Изабелле (на которой впоследствии женился сам Филипп), затем на принцессе Маргарите или же Марии Стюарт. Германский император Максимилиан II просил его руки для своей дочери Анны. По разным причинам Филипп остановился на кандидатурах Марии Стюарт и эрцгерцогини Анны. Однако впоследствии вариант с Марией Стюарт отпал, а решение вопроса о браке с Анной Филипп оттянул, сославшись на плохое здоровье принца и его душевное недомогание, или, как выразительно пояснил герцог Альба: «Отсутствие здоровья у принца вместе с другими недостатками, как телесными, так и умственными, делали его высочество, менее зрелым, чем это полагалось бы ему по возрасту» (1562 г.). В том-же году Филипп вел переговоры о приезде к испанскому двору двух своих племянников, австрийских эрцгерцогов, чтобы подготовить, их к наследованию испанского престола.
Так шли дела, когда вдруг несчастный случай еще более ухудшил состояние принца. Находясь в Алькала, климат которого был признан для него целебным и где он вел абсолютно беспечную жизнь, Карлос упал с дворцовой лестницы, сильно повредив себе череп. За его жизнь опасались в течение нескольких месяцев. К лету ему стало лучше, но с осени болезнь возобновилась. Нельзя, конечно, утверждать, что именно падение вызвало повреждение мозга. Верно лишь то, что в дальнейшем у принца стали появляться признаки помешательства или, во всяком случае, ярко выраженного умственного расстройства. На этом сходятся все свидетельства современников. Тем не менее Филипп, видимо, не желавший делать это достоянием гласности, велел арагонским кортесам принести Карлосу присягу как наследнику престола (1563 г.), а в 1567 г. Карлос был назначен председателем королевского совета.
