Из-за разницы во взглядах Хосе Морелос позже почти не участвовал в деятельности хунты. Он больше был занят практикой. Продолжая объединять патриотические силы на юге, Хосе Морелос установил связи со многими партизанскими отрядами. В середине ноября 1811 года Морелос активизировал свои действия — его полки овладели крепостями Чаута, Куаутлу и Теуакан. А к концу года почти целиком в руках повстанцев Морелоса оказались интендантства Гуанахуато, Гвадалахара, Мичоакан, значительная часть Паэблы, Веракруса и Мехико. Испанские гарнизоны держались лишь в немногих городах.
Встревоженные колониальные власти увеличили число карательных отрядов. За головы Хосе Морелоса и главы хунты Лопеса Района обещали большие деньги. Одновременно власти активизировали действия против повстанцев. 28 сентября войска Кальехи буквально стерли с лица земли революционный город Ситакуаро вместе с жителями. Поражение деморализовало главу хунты и его приближенных. Лопес Район решил пойти на компромисс. Вице-король получил от повстанцев письмо с проектом конституции, запрещавшей рабство, провозглашавшей отмену ограничений торговли с метрополией, свободу печати, неприкосновенности жилища. Проект конституции давал Мексике суверенитет в составе монархии. Но ответа от вице-короля хунта, естественно, не дождалась. «Еще чего, — хмыкал вице-король, время от времени вспоминая „наглое“ послание. — Если я и отвечу, то только картечью!»
Тем временем карательная армия Кальехи двинулась против повстанческой группировки Хосе Морелоса. В феврале 1812 года Кальеха осадил город Куаутлу. Повстанцы основательно подготовились к обороне и достаточно легко отбили все атаки. Тогда испанцы решили взять город длительной осадой. Но и это не удалось. Повстанцы Морелоса ночью, сняв посты испанцев, скрытно покинули город. Вместе с ними ушли многие жители. Испанцы спохватились лишь тогда, когда повстанцы уже переправились через реку. Каратели кинулись было в преследование, но Морелос приказал своим рассредоточиться, указав при этом пункт сбора. Сам он, упав с лошади, сломал два ребра, но тоже сумел скрыться…
Героическая оборона Куаутлу — одна из славных страниц истории войны за независимость Мексики. Даже Наполеон не удержался от похвалы: «Будь Морелос французом, я бы сделал его маршалом!»
Видя, что восстание не идет на убыль, испанцы согласились ввести в действие предлагаемую конституцию. В сентябре она была обнародована, а 5 октября вице-король опубликовал еще и декрет о свободе печати. Повстанцы же объявили Мексику республикой. Начались выборы в органы власти. В Мехико патриоты добились просто триумфального успеха: во всех округах были избраны мексиканцы и лидер движения Хосе Морелос.
