Параллельно с КСЭ-1 в районе работали два башкирских геофизика — Алексей Золотов и Иосиф Дядькин. Первый из них был горячим сторонником гипотезы Казанцева и поставил своей целью собрать доказательства в ее пользу. Пробыв в тайге неделю, он выпустил отчет, в котором, в частности, заверял, что радиоактивный фон на месте падения Тунгусского метеорита превышен.
Результаты экспедиций были раскритикованы специалистами — в том числе за предвзятость, обусловленную поисками «призрака звездолета». В заключении 9-й метеоритной конференции, проходившей в июне 1960 года, прямо говорилось: «Группа Золотова показала пример исключительно легкомысленного отношения к сбору материалов и их интерпретации. В результате кратковременного посещения района был представлен объемистый отчет (116 страниц), содержащий ряд домыслов и показывающий полную некомпетентность в решении поставленных вопросов, а также отсутствие у авторов элементарных представлений о сущности изучаемых явлений. Сведения <…> попали в печать и способствовали созданию как в Советском Союзе, так и за рубежом неверного представления о характере явления».
С тех пор новые экспедиции проводили неоднократные замеры радиационного фона в районе таежных вывалов, но всякий раз аномалии по превышению фона или наличию изотопов оказывались следами послевоенных ядерных испытаний.
Конечно, изыскания были продолжены энтузиастами, однако каких-либо явных свидетельств того, что над тайгой в 1908 году взорвалось ядерное устройство, не обнаружено. При этом исследование мутаций растений и насекомых в районе не упростило, а еще больше запутало вопрос. Сторонникам гипотезы Казанцева в данном случае приходится утешаться верой в то, что на инопланетном корабле стоял двигатель, работающий на принципах, которые пока не открыла земная наука. Но такое предположение является фантастическим допущением и выводит гипотезу за рамки научного обсуждения.
Что касается фрагментов звездолета, то их тоже пытались найти неоднократно. В июле — августе 1960 года состоялась масштабная экспедиция КСЭ-2. В ней приняли участие 73 специалиста, среди которых была и группа физика Владимира Кошелева, направленная в тайгу по указанию главного конструктора ракетно-космической техники Сергея Королева. Как свидетельствовал Георгий Гречко — участник КСЭ-2, ставший летчиком-космонавтом, — ракетчики отправились в зону Тунгусской катастрофы после изучения отчета Золотова. Хотя они со скепсисом отнеслись к гипотезе Казанцева, она их заинтриговала, поэтому Королев выделил деньги из специального фонда на изучение вопроса. Участники КСЭ-2 взяли несколько тысяч проб из Южного болота, составили подробное описание поваленных деревьев, сделали спилы, изучили золу на предмет радиоактивности и т. п. Однако, подчеркивал позднее космонавт, «все труды и результаты вроде бы обошлись без сенсаций»
