Мимо внимания Дарвина не проходят и факты возрастной изменчивости по морфологическим признакам, в том числе и по вторичным половым признакам. Так, новорожденный негритенок имеет красновато-коричневатый цвет кожи, переходящий вскоре в аспидно-серый. Глаза негритенка бывают голубой окраски, а волосы скорее каштановые, чем черные, и вьются только на концах. При рождении дети австралийцев имеют желтовато-коричневый цвет и темнеют со временем. У парагвайских гуаранов они беловато-желтые, но через несколько недель приобретают желтовато-коричневый цвет родителей. Возрастная изменчивость наблюдается и в географическом отношении: черная окраска у детей суданских племен появляется по прошествии года, а в Египте не ранее трехлетнего возраста.
В соответствии с поставленной задачей — показать генеалогическое родство человека с высшими животными Дарвин и при рассмотрении морфологических половых различий проводит их сравнительный анализ. У большинства видов животных самцы крупнее и сильнее самок, общеизвестным примером чего являются гориллы. Даже по такому незначительному признаку, как развитие надбровных дуг самцы некоторых обезьян отличаются от самок и приближаются в этом отношении к людям. Самцы многих обезьян снабжены бородой, самки же ее не имеют, что характерно для человека. Более развитый волосяной покров у мужчин копирует такое же различие у некоторых четвероруких. Самцы обезьян, подобно мужчинам, смелее и воинственнее самок, они предводительствуют в стаде и активнее защищают его от врагов. Впрочем, у некоторых видов (горилла, орангутанг, павианы) различия между полами по величине клыков, густоте и цвету волосяного покрова более резкие, чем у человека, но с чем это связано, Дарвин не поясняет. Из приведенных сравнений по морфологическим признакам очевидно, насколько «велик параллелизм между половыми различиями у человека и четвероруких».
Психологические и умственные различия между представителями разных полов также существенны для понимания роли отбора в эволюции человека. Рассуждения Дарвина на данную тему не имеют прямого отношения к физической антропологии как науки об изменчивости морфологических признаков, однако они интересны в связи с рассмотрением половых различий в развитии нервной системы (функций мозга) — важнейшей особенности человеческого организма. Многие из этих рассуждений спорны и даже неприемлемы с нашей точки зрения, но они отражают состояние науки и общественное сознание того времени, которые нашли место и в субъективных оценках Дарвина.
