Тем временем во владениях Элизы после нескольких стычек с неаполитанцами через Ливорно шла эвакуация последних французских частей. Земли Великой герцогини были захвачены англичанами и австрийцами. Услышав о приближении австрийцев, Элиза бежала из Лукки, хотя была уже на девятом месяце беременности, и в убогой придорожной гостинице разродилась мальчиком. Она успела добраться до Болоньи, однако была арестована австрийцами, которые тотчас отправили ее через Триест в Брюнн (Брно) в Богемии. Несчастной Элизе пришлось собственноручно упаковывать вещи на виду у австрийских офицеров. 15 апреля она писала одной из подруг: «На нас обрушилась ужасная катастрофа. Все потеряно. Я решила выехать в Неаполь. Я ни за что не смогу жить на Эльбе. Я бы хотела обосноваться в Риме, если не станет возражать правительство Франции и позволит папа». Даже в этой ситуации она еще надеялась получить мало-мальскую компенсацию. Однако австрийцы не давали ей разрешения покинуть Брюнн еще до осени следующего года.
Единственной частью империи, которой удалось выжить, было королевство Неаполитанское, хотя Фуше, со свойственной ему прозорливостью, предупредил Элизу, что согласие между австрийцами и Мюратом окажется недолговечным. Король Иоахим присоединился к австрийцам под командованием генерала Ньюджента, ирландца по происхождению, в феврале возле Болоньи. Однако Мюрат вызывал раздражение со стороны союзников тем, что не принимал участие в боевых действиях, пока не получил подтверждение, что император Австрии гарантирует ему трон. В марте в Тоскане высадился лорд Уильям Бентинк со своими британским корпусом, в составе которого, к великому негодованию Иоахима, были и сицилийские части под бурбоновским флагом. Сицилийцы потребовали, чтобы неаполитанцы оставили Великое герцогство. Мюрат пришел в бешенство. Он с большим трудом сдержал себя, чтобы не обрушиться на нахальных соперников, и возобновил переговоры с Евгением. Мюрат прекрасно понимал, что Бентинк — его смертельный враг, вознамерившийся во что бы то ни стало реставрировать в Неаполе изгнанных оттуда Бурбонов. В апреле в папские земли вернулся Пий VII, и Мюрат был вынужден уйти из Рима. Увы, его мечтам стать королем всей Италии так и не суждено было сбыться. Австрийцы тоже были глубоко в нем разочарованы.
На Венском конгрессе одно за другим выдвигались предложения, что бонапартовские выкормыши должны уступить место законным властителям, получив в качестве компенсации какое-нибудь второстепенное княжество, например Ионические острова.
