В 1990—1995 годы изучено накопление токсикантов в почве, подстилке, сосновой хвое, загрязнение снеговых осадков, определен уровень токсического накопления техногенной серы хвоей сосны. С 1991 года работы по локальному мониторингу лесов в границах области получили уровень регионального статуса и продолжались в рамках темы «Мониторинг лесов Украины».
Актуальной для Донбасса и его лесного хозяйства проблемой остается ухудшение состояния пойменных лесов. Для разработки путей повышения их устойчивости исследования проводятся с 1985 года (Л. Л. Зятьков). Изучены экологические особенности лесорастительных условий, состояние, продуктивность, закономерности формирования, рост и устойчивость лесных насаждений поймы. Уточнены причины усыхания дубовых и сосновых лесов, степень повреждения и выживания их, разработан комплекс мероприятий, связанных с новыми технологиями создания культур и рубок ухода, разработаны рекомендации по ведению лесного хозяйства на зонально-типологической основе. Производству переданы практические рекомендации по ведению лесного хозяйства в пойменных дубравах среднего течения р. Северский Донец.
Проблемой создания плантаций орехоплодных пород на Востоке Украины занимался А. И. Торба.
После сильных лесных пожаров возникла острая необходимость в научном обосновании лесовосстановления на гарях. В результате комплекса исследований разработаны рекомендации по восстановлению леса на гарях и ведению хозяйства в них, которые могут быть использованы и за пределами региона станции.
Совершенствуются технологии и способы создания хвойных и лиственных культур на вырубках на базе имеющейся и перспективной техники и использования крупномерного посадочного материала. Результаты этих и других научных разработок лежат в основе тактики и стратегии ведения лесного хозяйства региона.
В разные годы на станции проводили исследования многие известные ученые: Ю. В. Архипов, Л. И. Бражко, А. П. Генов, Л. Ф. Генова, И. И. Гордиенко, В. В. Гречуха, Л. М. Ксенофонтова, А. А. Куприянов, А. Ф. Лисенков, Н. А. Лохматов, Н. Е. Поляков, Л. П. Полякова, И. П. Селитренников, А. И. Симоненко, И. И. Старченко, В. Г. Ступников, Л. Т. Устиновская и другие.
Значительный объем исследований станции в регионе посвящен вопросам агролесомелиорации. Идеи и замыслы В. В. Докучаева о необходимости комплексного решения проблемы защиты сельскохозяйственных угодий от неблагоприятных климатических условий путем установления оптимальных для региона соотношений разных видов сельскохозяйственных угодий, лесов и вод со временем не только не утратили актуальности, но и еще больше обострились.
