28 июля 1941 года ГКО принял решение о создании самостоятельных органов тыла Красной Армии. 1 августа 1911 года были образованы Главное управление тыла Красной Армии и управления тыла фронтов и армий. Во главе тыла Красной Армии был поставлен генерал А. В. Хрулев, исключительно энергичный и опытный организатор.
Новая структура тыла Красной Армии, фронтов и армий вполне соответствовала новым условиям ведения войны. А вновь созданные органы управления тылом получили больше прав и возможностей для проявления широкой организационно-хозяйственной инициативы.
Объединение в одних руках функций планирования, управления и организации тылового обеспечения войск, подчинение начальнику тыла всех коммуникаций и транспортных средств позволило более гибко решать сложный комплекс вопросов по тылу, рационально использовать все виды транспорта и навести должный порядок на всей территории тыла фронтов и армий. Новая структура тыла позволила коренным образом улучшить постановку лечебно-эвакуационного дела на фронтах. Установилась более тесная связь военно-тыловых органов с народным хозяйством страны, что дало возможность полнее и лучше использовать в интересах фронта местные ресурсы.
Первоначально новая структура была введена только в центре, на фронтах и в армиях, а в корпусах и дивизиях сохранялся прежний порядок — там за всю работу тыла отвечали общевойсковые штабы. Это приводило к тому, что начальник тыла армии вынужден был давать указания по тылу службам, которые ему не подчинялись. Поэтому в мае 1942 года в соединениях была учреждена должность заместителя командира по тылу, несшего ответственность за организацию тылового обеспечения частей и соединений. Таким образом, к этому времени было достигнуто единообразие организационной структуры тыла.
Прав генерал Антипенко, выдвигая положение о целесообразности дальнейшего совершенствования организационной структуры тыла Вооруженных Сил не только в военное, но и в мирное время.
Военная обстановка потребовала организовать железнодорожные, дорожные и автомобильные войска. В ходе операций выявились большие неудобства в управлении этими войсками. Восстановление железных дорог велось войсками двух ведомств — Наркомата обороны и Наркомата путей сообщения, что, естественно, отрицательно сказывалось на восстановительных работах.
Решением ГКО 2 января 1942 года руководство всеми восстановительными и заградительными работами на железных дорогах было возложено на Наркомат путей сообщения СССР, в системе которого было образовано Главное управление военно-восстановительных работ.
