Для «оказания помощи органам народной власти в переходный период» во вновь сформированные областные управления НКВД было направлено 726 человек оперативного состава НКВД из России и восточных районов Украины, а впоследствии — дополнительно ещё 600 кадровых офицеров служб НКВД и выпускников оперативно-чекистских школ. В 1940 г. были проведены три массовые депортации населения из Западной Украины. В феврале были вывезены в Сибирь, Казахстан и республику Коми в спецпосёлки НКВД более 137 тыс. польских осадников и лесников с семьями. В апреле в Казахстан были депортированы около 61 тысячи членов семей членов арестованных участников подпольных организаций, офицеров польской армии, полицейских, тюремщиков, жандармов, помещиков, фабрикантов и чиновников польского государственного аппарата. Главы этих семей в основном были расстреляны. В конце июня были депортированы около 78 тысяч беженцев с территорий Польши, оккупированных нацистской Германией, которые отказались принять советское гражданство. По данным А.Э. Гурьянова, полученным в результате специального исследования различных источников, общее число выселенных составляет около 320 тысяч.
Данные о масштабах репрессий по отношению к местному населению после присоединения Восточной Польши к СССР и установления советской власти, приводимые в различных источниках, существенно отличаются друг от друга. Наиболее объективными представляются данные сотрудников НИПЦ «Мемориал» О.А. Горланова и А.Б. Рогинского, обработавших статистические сводки Главного управления государственной безопасности НКВД СССР по лицам, обвиняемым в контрреволюционных преступлениях в период с сентября 1939 г. по июнь 1941 г.
По данным исследователей, «общее число арестованных ДТО и областными управлениями НКВД на бывших польских землях в предвоенный период составляет 107 140. К этому числу следует прибавить ещё несколько сот арестованных там же Особыми отделами военных округов. В результате получаем примерно 107,7-108 тысяч арестованных». Если же считать число арестованных с начала ввода войск, то есть с сентября, то аресты в западных областях Украины и Белоруссии составили 65,6 % от общего числа арестованных по Союзу. Репрессии были действительно массовыми. Арестам и депортациям были подвергнуты более 400 тысяч человек, то есть более 3 % от общего числа жителей бывших польских земель. За весь довоенный период советской истории более интенсивными были только репрессии во время коллективизации. Не добавило любви к сталинскому режиму и такое жестокое преступление, как «разгрузка тюрем» или «убытие по 1-й категории», совершённое в первые дни войны. В тюрьмах Западной Украины к началу войны находилось 23 236 заключённых. Ужасная картина вырисовывается при ознакомлении с отчётными документами Польской комиссии общества «Мемориал» (А. Гурьянов) и Государственного архива Российской Федерации (А. Кокурин) об эвакуации тюрем из областей Западной Украины.
