Немалая часть трудов великого ученого была посвящена зоологии. Среди прочих работ до нас дошла его "История животных" в 10 книгах. Аристотель первым систематизировал животных, разделив их на девять групп. Пять из них обладают кровью; это "четвероногие живородящие" — млекопитающие; "четвероногие яйцеродные" — земноводные и часть пресмыкающихся (ещё в XIX веке их объединяли в общую группу, названную "гады"); "яйцеродные, крылатые, двуногие, летающие, покрытые перьями" — птицы; "живородящие, дышащие лёгкими, безногие, водяные животные" — киты; "яйцеродные, реже живородящие, чешуйчатые или голые, безногие, дышащие жабрами водяные животные" — рыбы. Интересно, что хотя учёный и не признал китов млекопитающими, но и к рыбам их не отнёс.
"Бескровных", как полагал Аристотель, животных, он разделил на четыре группы: "без резкого разделения твёрдых и мягких частей, с внутренним окостенением, с ногами на голове" — "Мягкотелые" (теперь это головоногие моллюски); "многоногие, покрытые роговой скорлупой, защищающей мягкое тело" — "Мягкоскорлуповые" (теперь это десятиногие ракообразные); "мягкотелые, с твёрдой ломкой раковиной" — "Черепнокожие" (то есть все моллюски, кроме головоногих). И, наконец, "многоногие, с телом разделённым на отрезки" — "Насечённые", по-гречески "энтома". От этого слова произошло и русское слово "насекомые", и название науки о насекомых — энтомологии. Но Аристотель этим словом называл и насекомых, и многоножек, и паукообразных.
Система эта, конечно, неполна и несовершенна, но ведь Аристотель был первым человеком, вообще задумавшимся о необходимости такой системы. И как много он увидел и понял! Его главный принцип — устанавливать факты, полагаясь на наблюдения; и теория верна только тогда, когда она основана на наблюдениях. Великий ученый древности писал, что все науки начинаются с удивления, то есть с любопытства, любознательности. И сам он обладал неистощимой любознательностью — свойством, без которого не бывает настоящего учёного.
Аристотель описал около 500 видов животных, среди них 120 рыб и 60 насекомых. Он анатомировал их, ставил эксперименты. Открыл, что у акулы-катрана новорожденный детёныш соединён с матерью чем-то вроде пуповины — это наблюдение было повторено только в середине XIX века. Аристотель описал спаривание головоногих, опять же подтверждённое через много веков. Он исследовал глаз крота, изучил строение внутреннего уха животных, обнаружил, что у куриного зародыша уже на третий день насиживания начинает биться сердце. Изучая морского ежа, он открыл его жевательный аппарат, который до сих пор так и называется — аристотелев фонарь. Первым из европейцев Аристотель проследил превращение бабочки от яйца, "меньшего, чем зерно проса", в личинку-гусеницу; она растёт, пока не превратится в куколку, окружённую подобием ткани, из которой вылетает "крылатое создание, которое мы называем бабочкой". Он наблюдал, как оса, названная им "ихневмоном", затаскивает в норку пауков, как он думал, убитых (на самом деле парализованных) и откладывает на них личинок (здесь он ошибся — оса-помпил откладывает на добычу яйцо). Он узнал, что кукушка подкидывает свои яйца в гнёзда других птиц, а глаза хамелеона могут смотреть в разные стороны — один вперёд, другой назад.
