В 1906–1907 годах, Бонч-Бруевич, был секретарём большевистского теоретического журнала "Наша мысль".
Добившись удовлетворительных, по мнению вождя, результатов, Бонч-Бруевич по его призыву срочно вернулся в апреле в Женеву, чтобы по поручению партии организовать там издательство "Демос". Ленин прекрасно помнил, как замечательно удалось Бонч-Бруевичу организовать подпольные типографии в Москве и в Петербурге, и мечтал вновь использовать его таланты в этой области, когда это было особенно, позарез необходимо. Бонч-Бруевич не подвел его ожиданий, и стремительно организовал издательство "Демос", которое сразу же приступило к полномасштабному изданию остро необходимых революционных брошюр и агитационных листков. За это Бонч-Бруевич получил весомую награду — его сделали членом Комитета заграничной организации РСДРП (большевиков). Теперь он стал одним из членов высшего руководства партии.
К началу 1906 года, революционный подъем закончился. Правда, закончился он все — таки на высокой ноте, теперь в России населению были дарованы многочисленные свободы. Большевики поспешили ими воспользоваться. Бонч-Бруевич был вновь направлен в Петербург, чтобы стать сотрудником в первой легальной большевистской газете "Новая жизнь".
В 1906–1907 годах, он работал секретарем и членом редакции социал-демократического журнала и издательства "Наша мысль". Сотрудничал в легальном большевистском журнале "Вестник жизни" и в журналах "Современный мир", "Образование", "Минувшие годы". Участвовал в организации легальных большевистских газет "Вперед", "Волна", "Эхо", заведовал большевистским издательством "Вперед" и его книжным складом.
Но в 1907 году вновь наступил период реакции, и наступления на уже отвоеванные, казалось бы, свободы. Издательство "Вперед" было разгромлено, а Бонч-Бруевич — арестован при разгроме и предан суду и заключен в тюрьму Кресты.
Но просидел он там недолго. Вина его была сочтена не слишком сильной, и из тюрьмы его быстро выпустили. Бонч-Бруевич продолжил вести большевистскую работу, но уже гораздо осторожнее. Он участвовал в работе думских социал-демократических фракций, осторожно вел агитационную работу среди рабочих, организовывал рабочие клубы. В течение 1907–1914 годов он был постоянным членом консультативной группы социал-демократической фракции II, III и IV Государственной думы, используя все широкие легальные возможности для социал-демократической пропаганды.
Навыки опытного подпольщика никуда не делись, и он стал подпольным секретарем большевистской партийной организации Песковского района Петербурга, участвовал в организации нелегальной типографии, которая печатала большевистскую военную нелегальную газету "Казарма" и распространяла ее среди солдат и матросов.
