В судебном отношении Кузнецкий уезд подчинялся Барнаульскому окружному суду (всего в Томской губернии было 6 судебных округов). В Кузнецке находилось также уездное по воинским делам присутствие, председателем которого являлся все тот же уездный исправник, заместителем - воинский начальник Н.С. Сухов. Сельское управление подчинялось крестьянским начальникам, стоявшим во главе участков из нескольких волостей. Таковыми в 1913 г. были: титулярный советник (9 класс) А.П. Миролюбов, коллежский асессор (8 класс) Б.Н. Пермикин, надворный советник (7 класс) Л.А. Шавров.
Крестьянское самоуправление в селах регламентировалось Положением 1879 года, по которому сельский сход домохозяев решал вопросы распределения земли, раскладки податей, выполнения государственных повинностей и выхода из общины. Во главе села стоял сельский староста, избиравшийся сходом на 3 года. В Кузнецке действовало городское самоуправление, решавшее вопросы хозяйственной жизни города, организации торговли, кредита, здравоохранения, образования, культуры, транспорта и благоустройства. В отличие от другого кузбасского города - Мариинска - Кузнецк по статусу не имел Городской Думы. Но жителям предоставлялось право избрания городского управления во главе с городским старостой на 3 года. В 1898 г. городским старостой был некто Быстров, уполномоченными -жители города: Сунгуров, Шаньгин, Шунков, Недорезов, Панов, Токмаков, Фамильцев, Плеханов, Малев, Утенко. В 1913 г. город возглавлял городской староста П.С. Тытнянов, его помощниками были П.А.Темников и А.П. Рохин. В управе состояли 8 уполномоченных: Т.И. Солодилов, Г.Я.Чулошников, B.C. Коновалов, В.К. Шукшин, Д.Ф. Вилесов, М.Ф. Филиппов, М.И. Федоров, П. А. Абрамов.
В церковном отношении уезд находился в ведении Томской епархии, возглавляемой епископом томским и алтайским Мифодием. Кузнецким благочинным являлся священник Н. Рудичев.
Крупнейшим учреждением города после Городского Управления и церкви была тюрьма - так называемый Кузнецкий тюремный замок. Смотрителем тюремного замка в 1898 г. был Семен Самойлович Титов. В уезде существовало также Отделение попечительного о тюрьмах Комитета в составе уездного исправника, благочинного священника, городского старосты, врача (А.М. Карпов) и представителя городского населения - купца М.Э. Окулова.
В городе действовало (в 1898 г.) 2 церковно-приходских училища (мужское и женское) и 1 уездное народное училище (на 50 мест, при двух учителях). Плата преподавателям (и Закона Божьего, и естественных дисциплин) осуществлялась из городской казны и составляла 15 рублей в месяц на каждого (жалованье полицейского, к слову, было 17 рублей). Наблюдение за преподаванием в городе осуществлял штатный смотритель училищ. Кроме того, в городе было 2 врача, фельдшер и 3 повивальных бабки. В уезде - 3 врача, 25 фельдшеров, 7 повивальных бабок. (Это были самые высокие показатели по Томской губернии. Большее число медиков было только в самом Томске).
