Когда число насельников стало значительным, они с благословения Новгородского архиепископа Иоанна II завладели Валаамом, изгнав оттуда язычников – карел.
Первой была построена церковь во имя Спаса Преображения с приделами во имя Иоанна Богослова и Николая Чудотворца, затем – церковь во имя Рождества Господа.
Преподобный Сергий закончил свои дни не на Валааме. Из-за серьезного конфликта с братией он вынужден был удалиться в Новгород, в монастырь Иоанна Богослова. Там он занимался переписыванием церковных книг и там же был похоронен. Его преемником на Валааме стал инок Герман, до того во всех трудах бывший вместе с преподобным Сергием.
Мощи преподобного Сергия в 40-х годах XVI века были перенесены из Новгорода в Валаамский Спасо-Преображенский собор и положены за алтарь. Туда же положили и мощи второго игумена Валаамского монастыря Германа. С тех пор мощи неоднократно являли чудеса: помогали утопающим и замерзающим на Ладоге, исцеляли от физических и психических
Пришельцы поселились на небольшом островке, поставили на нем церковь во имя Преображения Господня и стали жить монастырской общиной.
болезней, защищали монастырских иноков от клеветы, являли местным жителям видения преподобных Сергия и Германа. Тогда же началось местное их почитание, а с 1819 года преподобные были причислены к лику святых.
1578 году на Валаамский монастырь напали шведы и зарубили восемнадцать старцев и шестнадцать послушников. При следующем разорении монастырь был сожжен, иноки перебрались в другие монастыри или стали отшельниками. В 1611 году шведы окончательно уничтожили обитель.
Восстановление Валаамского монастыря началось в 1715 году при Петре I. Четыре года спустя над мощами преподобных Сергия и Германа был освящен деревянный Спасо-Преображенский собор. В 1729 году построена Успенская трапезная церковь. Но все постройки Петровской эпохи не сохранились – разрушились от стихий и пожаров. Ныне стоящие сооружения относятся к XIX–XX векам.
Точная дата основания Валаамского монастыря до сих пор неизвестна. Причина этого кроется в трагической судьбе монастыря – он множество раз разорялся, иноки не раз бежали из него, в результате чего монастырский архив был утерян.
К 1940 году Валаамский монастырь пришел в полное запустение. Оставшиеся в живых иноки перебрались в Финляндию, где основали Ново-Валаамский монастырь. Старая же обитель погибала и приходила в запустение.
Однако в 80-е годы Валаамский монастырь снова начал возрождаться
