В 1899 году после возобновления был вновь торжественно освящен, 24 августа, придел преподобных Зосимы и Савватия, Соловецких Чудотворцев.
В этом же году, 14 ноября состоялось освящение придела в честь св. Евдокии. Торжество освящения и литургию, а накануне и всенощное бдение совершал архимандрит Николо-Угрешского монастыря Валентин, соборне, при пении хора певчих.
К XX веку в храме свт. Николая в Котельниках сохранялись святые иконы XVII века. Так в иконостасе придельного храма во имя Преподобных Зосимы и Савватия была икона Казанской Божией Матери, вышиною 11 вершков, шириной 9½ аршин, на ней внизу надпись: «Истинное изображение и список с Чудотворного образа, что слывет Смирных во граде Калуге, а писал изограф Афанасе». Надпись сделана на серебряном окладе. «В особенном иконостасе у придельного храма во имя Мученицы Евдокии находилась икона Феодоровской Божией Матери, на полях – ее иконы Великомучеников Феодора и Андрея Стратилатов, древнего письма. На Богоматери – обруч железный со стразами, риза, венец и оклад, серебряные низкой пробы».
«Придельного храма храмовая икона Преподобных отец Зосимы и Савватия с чудесами в ризе и окладе серебряных, вызолоченных», помещалась в иконостасе. «Икона Владимирской Божией Матери с чудесами в ризе, низанной жемчугом в окладе серебряном золоченом, поставлена в киоте за стеклом. Письмо обеих икон признается иконописцами за Строгановское».
Храмовыми святынями считались «четыре напрестольных креста серебряных, вызолоченных с частицами мощей. Один чеканной работы, на верхней стороне изображение распятия, по сторонам – четырех предстоящих, внизу – святителя Николая, под святителем надпись «1743 год». Внизу надпись: «Сей Живоначальный Крест приложен к церкви свт. Николая Чудотворца, что в Котельниках. Дому Высокопревосходительных баронов Строгановых служитель Петр Иванович Хлебоедов».
Церковь свт. Николая Чудотворца, что в Котельниках закрыта после 1922 года.
Во время «Комиссии по изъятию церковных ценностей из церквей Рогожско-Симоновского района в пользу голодающих Поволжья» Московская Губкомиссия распорядилась, чтобы Районная комиссия, созданная при Совете Рабочих депутатов Рогожско-Симоновского района собрала необходимые документы на предприятиях района для принятия резолюции в пользу изъятия. На сорока предприятиях с 24 по 30 марта 1922 года (всего за неделю) Районной комиссией спешно были собраны документы якобы подтверждающие голосование за изъятие церковных ценностей подавляющего большинства рабочих района. Списки проголосовавших в документах не найдены. Есть общий список предприятий, с «круглым» количеством «присутствовавших». Вот выписка из этого документа:
