"Мускэ" доблестно вступил в безнадежный бой с "Эмденом" и очень скоро был потоплен. Мюллер весьма человечно отнесся к оставшимся в живых, подобрал их, оказал им полное внимание, а затем полным ходом ушел. Потери на "Жемчуге" составили 91 убитыми и 108 ранеными. Впоследствии командир и старший помощник были осуждены военным судом к строгому наказанию за непринятие мер предосторожности. Другие слабые французские корабли (старая торпедно-канонерская лодка и 2 миноносца), находившиеся в гавани, не приняли участия в бою, а если бы и приняли, то погибли бы бесцельно. На эскадренном миноносце "Мускэ" 43 чел. погибло и 36 попали в плен; из которых 5 вскоре умерли от ран.
После этого смелого дела "Эмден" пошел на запад к Никобарским островам, захватив по пути британский пароход -свой последний приз, который он отправил с пленными в порт на Суматре. В последний раз он принял уголь вблизи одного из маленьких островов к западу от Суматры, всего произведя за свое плавание 11 угольных погрузок. 5 ноября он пошел к Зондскому проливу, а затем повернул и направился к Кокосовым островам – маленькой группе островов в Индийском океане, где Мюллер намеривался разрушить кабельную станцию. Это был с его стороны опрометчивый поступок, так как он должен был бы догадаться, что в Индийском океане его ищут многочисленные союзные военные корабли. Правда, он не мог знать, что как раз в это время целая союзная эскадра находилась вблизи, занятая конвоированием транспортов с австралийскими и новозеландскими войсками. Радиопереговоры стали редки, а те, которые удавалось перехватить, кодированы, так как англичане установили наконец строгую радиодисциплину.
9 ноября рано утром Мюллер подошел к Кокосовым островам и высадил десантную партию, чтобы уничтожить кабели и радиостанцию. Но радиостанция все же успела передать важное известие: "Неизвестный корабль у входа", а кабельная станция послала по нескольким кабелям сообщения, которые привели в движение с полдюжины британских кораблей. Быстрота и находчивость властей Кокосовых островов были вознаграждены крупным успехом. В тот же день в 7 час. командир "Мелбурна" ("Melbourne") Сильвер, командовавший отрядом, который конвоировал транспорты с австралийскими войсками и находился в 55 милях к северу, принял эту радиограмму и, немедленно оценив ее значение, выслал на поиски противника легкий крейсер "Сидней" ("Sydney") (командир Глоссоп). Японский броненосный крейсер "Ибуки" просил чести выполнить это задание, но он был настолько сильный корабль, что его оставили в составе конвоя на случай появления других германских кораблей.
