Скорей всего, арест начальника Спецотдела в 1937 г. проходил так, как об этом впервые рассказал Олег Грейгъ:
— Иосиф Виссарионович Сталин в какой-то момент вполне логично рассудил: Бокий создал мощнейшую в мире научную школу, конгломерат научных школ и мыслей, — и это гораздо опаснейшая сила, нежели та, что имеется у Ежова, у Ворошилова, у Академии наук. И теперь настало время Бокия взять и арестовать. На загородную виллу Г.И. Бокия пришли сотрудники сталинской партийной разведки во главе с Александром Евгеньевичем Головановым (а не чекистами, как пишут нынешние историки) и объявили, что в соответствии с распоряжением Генсека партии ему следует незамедлительно явиться с ними в Кремль. Бокий не сомневался, что это арест и что охрана у его особняка заменена. Однако, не потеряв самообладания, Глеб Иванович в запале бросил Голованову: «Что мне Сталин! Меня на эту должность назначил Ленин!» Но его игра была проиграна, Голованов приказал подчиненным связать Бокия, и в таком виде тот был доставлен вскоре в один из монастырей партийной разведки. Одновременно группа сотрудников партийной разведки произвела аресты охраны зданий и лабораторий Спецотдела; вся важнейшая научная и иная документация была извлечена, часть сотрудников уничтожена, тогда как другая часть сотрудников и ученых Спецотдела стала работать на Секретариат товарища Сталина, то есть, иными словами, — на партийную разведку, ибо иным выходом из ситуации для них была только смерть. С этого момента Иосиф Виссарионович Сталин оказался вне досягаемости своих противников! Что дало ему основания устроить кровавую бойню по уничтожению соратников Ленина и всех неугодных ему чиновников…
Итак, в ночь с 15 на 16 мая 1937 года Глеб Иванович Бокий был арестован. Почти одновременно с ним арестовали и А.В. Барченко, того долгое время не беспокоили, но спустя почти год расстреляли. А вот Глеба Ивановича вместе с рядом его уникальных работников перевели в ведомство, которое впоследствии станет неофициально называться партийной разведкой лично товарища Сталина. Ирония зловещей судьбы! — как и каждый из десятков ученых, желанием одного человека заточенный в неволю и прежде работавший на него, сам Бокий станет пленником Сталина, официально «расстрелянный» и все-таки живой и дееспособный…
В его услугах талантливого организатора и ученого вождь перестанет нуждаться в ночь начала военных действий с Германией. И на следующий день, около 8 утра 23 июня 1941 года в одном из многочисленных сводчатых кабинетов подмосковного монастыря прогремит выстрел. Глеб Иванович Бокий будет застрелен в затылок выстрелом из револьвера системы «наган».
