В XVII веке на территории средневековой крепости были предприняты попытки ограничить число кремлевских захоронений. Так, 5 марта 1657 года царь Алексей Михайлович издал указ, по которому запрещалось погребать людей на кладбищах при некоторых кремлевских храмах. Эти кладбища подлежали немедленному закрытию, но, как свидетельствуют археологические находки, их продолжали использовать и во второй половине XVII – в XVIII веке. Здесь хоронили в основном членов семей священнослужителей кремлевских соборов.
По оценкам исследователей, на кремлевской территории с XII века было погребено не менее 6 тысяч человек. В результате редких археологических работ обнаружено и идентифицировано лишь 324 захоронения. Нарушать покой могил в Кремле считалось в порядке вещей, особенно при большевиках, сравнявших с землей основную часть кладбищ. Поэтому на сегодняшний день из 16 кремлевских некрополей, храмов-усыпальниц и кладбищ сохранились всего два – некрополи Успенского и Архангельского соборов, а также некрополь бывшего Вознесенского монастыря, служивший усыпальницей для женщин великокняжеского и царского рода.
По словам исследователей, кладбища существовали и на Красной площади. Так, от Спасской до Никольской башни было 15 погостов около каждой церкви. И только в конце XV века, когда на Красной площади был страшный пожар, Иван Третий приказал отнести все строения от Кремлевской стены на сто саженей, а погосты перенести в Дорогомилово, что вызвало сильное возмущение и недовольство москвичей. Они осудили государя, обвинив в кощунстве, и до конца жизни за глаза называли «позорником».
При внуке великого князя, Иване Грозном, захоронения на Красной площади возобновились. Так, сам Грозный участвовал лично в похоронах Василия Блаженного в соборе церкви Святой Троицы. Позже над захоронением знаменитого юродивого был выстроен придел, по которому храм получил свое известное на весь мир название – собор Василия Блаженного. Рядом с ним под спудом находятся мощи другого блаженного – св. Иоанна Московского.
Главную роль в сакральном пространстве Красной площади играет мемориальный некрополь у Кремлевской стены во главе с Мавзолеем Ленина. Это одно из самых известных и необычных кладбищ мира. Сама Кремлевская стена, выходящая на Красную площадь, является колумбарием для урн с прахом, вдоль стены также располагаются захоронения. Здесь хоронили видных государственных и военных деятелей СССР, деятелей науки и иностранных коммунистов.
