Несмотря на это было принято решение о восстановлении подводной лодки. Разработкой технической документации занималось Техбюро №-4 под руководством Б.М.Малинина. Чертежи составлялись путем съемок с натуры. Неоценимую помощь оказали найденные на подводной лодке после подъема технические описания и эксплуатационные инструкции. Восстановительные работы на подводной лодке проводил Балтийский завод, который, испытывая в то время недостаток квалифицированных специалистов, сначала пытался отказаться от заказа, но поскольку вводу L55 в строй придавали большое политическое значение, на подводной лодке развернули работы, которые обошлись в 1 300 000 рублей. В конце июля 1931 года полностью восстановленная L55 была предъявлена заводом Постоянной комиссии по испытанию и приемке кораблей. Принятая от промышленности подводная лодка использовалась для подготовки личного состава Подплава, а так же для проведения испытаний корабельной аппаратуры.
К началу Великой Отечественной войны L55 утратила боевое значение. В 1940 году подводная лодка была выведена из боевого состава и переформирована в опытовую. Во время войны L55, став зарядовой станцией, обеспечивала действия подводных лодок Краснознаменного Балтийского флота на коммуникациях противника.
19 августа 1940 года, с вхождением в состав СССР Прибалтийских республик, советский флот пополнился еще четырьмя подводными лодками. Две из них принадлежали Латвии, две – Эстонии.
Латвийские лодки «Ronis» и «Spidola» были построены во Франции в 1925–1927 годах. На момент вступления в строй Краснознаменного Балтийского флота большой боевой ценности эти подводные лодки уже не имели и предназначались для использования в качестве плавучих зарядовых станций. Начавшаяся война перечеркнула эти планы, застав подводные лодки в ремонте на заводе «Tosmare» в Либаве, где они были взорваны личным составом в ходе боев за город на второй день войны.
Эстонские подводные минные заградители «Kalev» и «Lembit» были построены в Великобритании в 1937 году на средства, 40 % которых составляла выручка от продажи Перу эсминцев «Lennuk» и «Wambola», захваченных у РККФ в 1918 году («Австроил» и «Спартак»), и средства, собранные по подписке. В то время военное сотрудничество Эстонии и Финляндии зашло столь далеко, что, не имея официального договора о военной помощи, страны предусматривали совместные боевые действия против СССР на случай военного конфликта с участием одной из сторон и даже проводили совместные военные учения.
