В отчете Управления Уполномоченного Совмина СССР по делам репатриации (1952 г.) был также отмечен целый ряд недостатков организационного характера, помешавших осуществить полную репатриацию советских граждан и предотвратить образование новой эмиграции:
• некоторую роль в деле задержки репатриации на Родину всех советских граждан сыграли организационные неувязки, допущенные органами репатриации. Их организационная структура в начальный период не удовлетворяла ни условиям, ни масштабам работы. Отделы репатриации в армиях и лагерях были созданы с опозданием, когда репатрианты массой начали поступать с территорий, освобожденных Красной Армией и союзными войсками. Вопрос о посылке групп офицеров для проведения репатриации с территории Германии, оккупированной союзниками, не был разрешен сразу же по окончании военных действий. Не были своевременно подобраны и соответствующие кадры в западных зонах. В числе работников миссий по репатриации до 1947 г. не было ни одного офицера из латышей, литовцев и эстонцев. Работниками миссий не были использованы все возможности того периода для работы в лагерях перемещенных лиц. Большой поток возвращающихся из западных зон Германии и Австрии успокоил часть работников органов репатриации за рубежом, и репатриация некоторый период шла самотеком;
• не были своевременно приняты меры к вывозу советских граждан из лагерей, расположенных в районе Линца, в период отхода советских войск на новую демаркационную линию, в результате чего несколько тысяч советских граждан остались на территории, занятой американскими войсками в Австрии;
• передача иностранных граждан осуществлялась в короткие сроки и не была поставлена в зависимость от репатриации советских граждан;
• в связи с имевшимися фактами грабежа и насилия над местным немецким населением со стороны репатриантов, а также наличием в их среде военных преступников в конце 1945 г. был установлен порядок, запрещающий свободный выход из лагерей. Это мероприятие вызвало увеличение числа побегов из них, с связи с чем возникла необходимость их ограждения колючей проволокой, установления вышек и постов, освещения территории лагерей прожекторами, а также конвоирования репатриантов при выходе из лагеря на работы. Эти меры позволили сократить количество побегов, но не устраняли их полностью, т.к. в период отправки на Родину и в пути следования устранить побеги было почти невозможно. В связи с этим о режиме в лагерях становилось известно советским перемещенным лицам, находившимся в западных зонах, а враждебные Советскому Союзу различные организации и комитеты использовали это в целях усиления антирепатриационной пропаганды. В августе 1946 г. по распоряжению Ф. И. Голикова в лагерях была снята проволока и ликвидированы посты;
