Затем 20 ноября 1948 года Политбюро по инициативе Сталина приняло решение распустить ведущий подрывную работу ЕАК. После этого были закрыты в СССР еврейские газеты, альманахи, еврейские национальные театры в Москве, Минске, Одессе, Черновцах, Биробиджане. 28 января 1949 года в газете «Правда» была опубликована статья в поддержку антисемитских инициатив Сталина, в которой автор возмущался маскарадом: почему Абрам Гуревич именует себя Александром Гуреевым, а Адам Рабинович называет себя Андреем Родионовым, и т.д.
А в конце 1948 - январе 1949 года были арестованы еврейские лидеры и представители еврейской элиты: всего было арестован 431 человек. Был арестован даже член ЦК ВКП(б) С.А. Лозовский, который был членом ЦК ВКП(б), председателем советского Информбюро, и самой «тяжеловесной» политической фигурой в ЕАК после смерти С. Михоэлса. Решением ЦК ВКП(б) от 18 января 1949 г. С.А. Лозовский был выведен из ЦК ВКП(б) и исключен из партии, а 26 января 1949 года был арестован за антисоветскую деятельность. В начале 1949 года сняли с ГОСЕТа памятную доску в честь Соломона Михоэлса.
Следствие шло долго — более трех лет. Для сравнения — следствие по совершенно не обоснованному делу «русских националистов» —«ленинградскому делу», в результате которого Сталин репрессировал 2000 лучших русских управленцев, длилось около одного года. Часть арестованных евреев признала себя виновными, часть — нет. Евреи в ответ на репрессии вышли с плакатами «Отпусти народ мой» (цитируя просьбу Моисея к египетскому фараону).
На Западе по поводу притеснений евреев в СССР спешно развернули грандиозную пропагандистскую кампанию по дискредитации СССР в глазах общественного мнения. «Со столбцов английской прессы не сходил еврейский вопрос. Не сходил с очереди и в Америке вопрос о положении евреев в России», — констатировал известный еврейский деятель Слиозберг.
В рамках холодной войны «еврейский вопрос» в СССР был быстро превращен политиками США и Израиля в объект международной политики, стал плеткой для бичевания, постоянных обвинений, главной «гуманистической» картой Запада против СССР в «холодной войне». А Сталин стал «навечно» объектом ненависти евреев, и созданная им Советская Россия стала таким же объектом ненависти. И слилась ненависть к России монархической, царской с ненавистью к России Советской, как будто и не было счастливого торжества для евреев в 1917-1924 годах. На фоне этой гуманистической кампании «большой пацифист» лорд Бертран Рассел ратовал за скорейшую атомную бомбардировку СССР, а власти США, как мы наблюдали выше, готовили планы нападения на СССР. Сталин давлению извне не поддавался и запрещал евреям уезжать из СССР. «Это был замкнутый круг Запрет на выезд из СССР, естественно, подхлестнул у евреев сионистские тенденции, желание во что бы то ни стало уехать и, соответственно, антисемитизм у властей. Евреев старались «не пущать» на руководящие должности из-за боязни того, что они могут уехать и увезти с собой какие-то секретные сведения», — отмечал Ж. Медведев вполне обоснованное ограничение.
