С августа 1941 г. по октябрь 1942 г. останки Тимура находились в Москве, в мастерской Михаила Герасимова, которому после изучения черепа удалось восстановить в форме бюста облик завоевателя. С лета 1942 г. резко ухудшилась ситуация на южном направлении: немецко-фашистские войска заняли Крым, Ростов, вышли к Сталинграду. В октябре 1942 г. Каюмов второй раз встретился с Жуковым. Тот сообщил историю с проклятием Сталину. Сталин позвонил Усману Юсупову в Ташкент и приказал немедленно произвести захоронение останков Тимура. 28 октября Герасимов завершил свою работу и передал останки Тимура и Тимуридов в Академию наук СССР. 15 ноября Госкомиссия приняла решение о перезахоронении.
Есть данные, не подтвержденные, правда, официально, что в период с середины ноября до середины декабря 1942 г. боевой самолет Красной Армии с останками Тимура на борту облетел всю линию фронта. 19 декабря 1942 г. в Москве Сталин подписал директиву о наступлении в районе Сталинграда. 20 декабря в Самарканде состоялось захоронение останков Тимура и Тимуридов. Вскоре советские войска перешли в наступление, одержав победу в Сталинградской битве. В войне наступил коренной перелом, и линия фронта стала отодвигаться на запад.
Единственное печатное свидетельство погребения останков Тимура и Тимуридов удалось обнаружить только на страницах декабрьского (1942 г.) номера газеты «Правда Востока», выходившей в Ташкенте. Корреспондент «Правды Востока» присутствовал при погребении в Гур-Эмире. Вот этот текст:
«Днем 20 декабря 1942 года в темном подземелье мавзолея Гур-Эмир зажглись огни прожекторов. Правительственная комиссия, руководившая вскрытием склепов и исследованием останков Тимура и Тимуридов, приступила к завершению своей полуторагодичной работы. В присутствии членов экспедиции и представителей самаркандских научных и общественных организаций началось погребение останков Тимура и его сыновей Шахруха, Мироншаха, его внуков Улуг-бека, Мухаммед-Султана. Член правительственной комиссии М.М. Герасимов с большой тщательностью укладывает скелет Тимура на каменный пол склепа. Останкам придается то положение, в каком они находились в момент вскрытия.
Секретарь правительственной комиссии передает председателю стеклянную ампулу. В ней герметически закупорен акт комиссии о проведенной работе. В акте излагаются цели и результаты вскрытия склепов Тимура, Шахруха, Мироншаха, Улугбека и Мухемед-Султана. “Вскрытие погребений названных исторических лиц XV века, — говорится в акте, — было предпринято в связи с 500-летием со дня рождения великого узбекского поэта Алишера Навои и ставило своей целью дать возможно более полную характеристику эпохи Тимура и Тимуридов, в каковую жил и творил Алишер Навои”.
