Том 33. Разум, машины и математика. Искусственный интеллект и его задачи | страница 19
При создании нового средства, как правило, синтезируется новая молекула, взаимодействующая с неким белком и в конечном итоге нейтрализующая его действие.
В живых организмах белки участвуют в метаболическом каскаде — последовательности реакций. Следовательно, если молекула нейтрализует действие одного из белков, участвующих в интересующей нас последовательности реакций, каскад будет нарушен, а молекула станет хорошим лекарством.
В этом упрощенном сценарии лекарство препятствует взаимодействию белка-мишени с белком с и нарушает метаболический каскад.
Чтобы нейтрализовать один из этих белков, необходимо, чтобы молекулы лекарства соединялись с ним определенным образом. Следовательно, большая часть усилий при создании нового медикамента направлена на то, чтобы новая молекула присоединялась к активному центру нужного белка — мишени.
Чтобы определить, действительно ли молекула лекарства соединяется с молекулой белка, необходимо измерить энергию их взаимодействия. Энергия взаимодействия между молекулой-кандидатом и белком-мишенью — это энергия, которую необходимо приложить для сохранения связи в системе. К примеру, если мы хотим, чтобы магнит держался на двери холодильника, нам не нужно постоянно прикладывать какую-то силу. Достаточно мощный магнит, только поднеси его к дверце, сам по себе притянется к ней с определенной силой. В этом случае говорят: для того чтобы магнит оставался прикрепленным к дверце холодильника, требуется приложить отрицательную энергию.
Разумеется, молекула лекарства, которая не образует связи с молекулой белка-мишени, не окажет лечебного воздействия: такая молекула будет свободно перемещаться по кровеносной системе или тканям, никак не решая задачу нейтрализации белка. А хорошим лекарством будет соединение, для которого энергия взаимодействия будет отрицательной и минимально возможной, — это говорит нам о том, насколько сильно притягиваются молекулы лекарства и белка. Следовательно, основной параметр, значение которого следует оптимизировать при разработке нового лекарства, это энергия взаимодействия.
Подобные задачи, решение которых заключается в определении ряда оптимальных параметров (например, какой шахматной фигурой нужно сделать ход, чтобы выиграть партию, или какими должны быть положение и размеры балок моста, чтобы снизить стоимость строительства и повысить прочность конструкции), объединяются в категорию задач поиска. При этом часто требуется найти параметры, обеспечивающие максимальное значение некой математической функции. В этом случае поиск называется оптимизацией.