С большим трудом, она получила разрешение на помощь обездоленным и больным в Калькутте. Ей разрешили жить вне стен монастыря, с непременным условием соблюдения нищенства, целомудрия и поста. В 1948 году она оканчивает ускоренные курсы медицинских сестер. После этого она отправляется в самое неблагополучное гетто Моти Джил, где посвящает все свои силы благотворительной деятельности. Вскоре она открывает небольшую школу, где учит детей бедняков читать, выписывая буквы прутиком на земле. Годом позже у матери Терезы появляется первая последовательница. Девушка из богатой бенгальской семьи, одна из ее бывших учениц, приняла решение остаться с ней и посвятить себя помощи бедным и обездоленным. Вскоре число последовательниц возрастает до семи. Вскоре они получают в свое распоряжение верхний этаж дома. В 1949 году мать Тереза получает индийское гражданство.
В 1950 году с разрешения Ватикана она основала монашескую конгрегацию под названием «Сёстры Миссионерки любви», целью которой стало основание школ, больниц и приютов для больных, где не обращалось внимания на вероисповедание и национальность. На тот момент в ордене было всего двенадцать сестер, сейчас их насчитывается несколько тысяч. Пять лет спустя орден перешел непосредственно в подчинение папы Римского. Сперва членами ордена становились только жители Бенгала, потом они стали прибывать из всех стран мира. Но далеко не все могли выдержать более чем строгий устав ордена: молитва в четыре часа утра, отсутствие имущества кроме смены одежды и ежедневный тяжелый труд.
В 1952 году орден открывает первый дом для умирающих. Не в силах видеть людей, которые умирали прямо на улице, мать Тереза обращается к властям города Калькутты и ей выделяют заброшенный дом в пригороде, неподалеку от храма богини Кали. Сначала это вызвало резкий протест со стороны местных священнослужителей: они решили, что под предлогом благотворительности монахини навязывают жителям города христианство. Один из видных политических деятелей посетив приют, изменил к нему отношение. Как он впоследствии заявил, в этом доме работают живые богини, и призвал всех оказывать им посильную помощь. С середины пятидесятых годов мать Тереза начинает помогать жертвам проказы, отношение к которым в стране было поистине бесчеловечным. По своей инициативе она начинает создавать для них поселения, где больные могли бы спокойно жить и работать, не страдая от неприятия и презрения окружающих. Под руководством сестер они изготовляли сувениры из скорлупы кокосовых орехов, которые для них собирали бездомные дети. Индийское правительство выделило для них участок в 34 акра в пригороде Калькутты, где на благотворительные пожертвования было основано большое самообеспечиваемое поселение.
