Это вызвало серьёзные волнения среди еврейского населения. Кагальное правление обратилось к руководству города с просьбой возвратить мальчиков евреям. Выяснением обстоятельств случившегося занялся местный городничий. Были проведены опросы многочисленных свидетелей и длительные разбирательства, как на уездном, так и на губернском уровне. По разрозненным и плохо сохранившимся документам можно представить эту историю приблизительно в следующем виде.
Младший из мальчиков, Янкель Мордухович подошёл в городе к одному из студентов, обучавшихся в иезуитской школе, и сказал ему, что хочет принять христианскую веру. Янкель рассказал, что сам он из Луцка. Его родители умерли и он пришёл в Мстиславль, где живёт за счёт подаяний. Студент, выслушав мальчика, отвёл его к настоятелю монастыря.
Второй мальчик, Иосель Давидович свой приход в монастырь объяснял тем, что он внимательно в течение двух лет изучал священные еврейские и христианские книги и, когда он узнал, что пророки предвещали приход мессии, а Мессия — Христос был убит евреями, то решил перейти в христианскую веру. Существовала также версия, заключавшаяся в том, что при изучении иудаизма он не проявлял достаточного усердия и за это брат его бил и применял другие недозволенные методы воспитания. Поэтому он решил уйти к иезуитам и принять христианство. Его отец, Давид утверждал, что Иосель вскрыл сундук, в котором хранились семейные ценности, украл хранившиеся там деньги и бумажник с документами и, опасаясь наказания, сбежал в монастырь. На своём теле Иосель носил крест. Существовала версия, что его окропил водой один из студентов и таким образом он был окрещён.
Иезуиты говорили, что они действительно приютили мальчиков в монастыре, поскольку те бедствовали и изъявляли желание перейти в христианскую веру, но сам обряд крещения осуществлён не был.
Проводивший расследование городничий Мстиславля Дображанский о его результатах доложил Витебскому губернатору. К донесению были приложены свидетельства десяти человек. Рассмотрев обстоятельства дела, губернатор запретил производить крещение, считая, что дети ещё не достигли совершеннолетия, когда можно принимать решение о своей религиозной принадлежности. Одновременно он приказал доставить детей в Витебск для дальнейшего расследования. Иосель был допрошен у губернатора и отпущен с отцом. Янкеля же не смогли отправить к губернатору. Он в это время исчез из Мстиславля.
По одному из свидетельств его забрали дворяне Ходкевичи и увезли в своё поместье. По просьбе Ходкевичей, утверждавших, что они не знали о том, что существовал запрет губернатора на крещение мальчика, Янкеля 28 мая 1801 года окрестил ксендз Ретинский, настоятель Лодовицкого монастыря и дал ему христианское имя Георгий Квитковский.
