Облачившись, диакон и священник, перед началом проскомидии, умывают руки. Епископ совершает то же действие несколько раз, перед проскомидией и позднее, во время литургии. Омовение рук означает духовную чистоту, с которой должны приступать священнослужители к совершению великого Таинства. Омовение означает еще и очищение грехов, поскольку священнослужитель, как и любой человек, далеко не безгрешен и ему требуется стирание, изглаживание грехов перед богом. Диакон расставляет на жертвеннике священные сосуды: чашу справа, дискос слева, от стоящего лицом к жертвеннику. В определенном порядке располагаются и прочие священные предметы: лжица, копие, звездица и покрова.
Для проскомидии избирается пять просфор и вино. Просфоры, или приношение, должны быть из пшеничной муки, испеченные на воде, не черствые. Вино полагается виноградное и обязательно красное. Одна из просфор, как правило самая большая, служит для приготовления Агнца – обрезанного хлеба, являющегося прообразом Иисуса Христа, который потом употребляют во время Таинства Причащения. Этот хлеб называют по-гречески артосом. Во время обрезания артоса, вспоминается смерть за человеческие грехи Христа. Агнец приносится в жертву со словами: «Жрется Агнец Божий, вземляй грех мира, за мирский живот и спасение» – «Приносится Ягненок Божий, взявший на себя грехи мира, во имя жизни и спасения человеческих душ». Агнец, или ягненок – жертвенное животное древних евреев, которое убивалось на Пасху. Хлеб, символизирующий Иисуса, пронзается копием со словами: «Один из воинов пронзил копьем Его ребра, и вытекла кровь и вода», что свидетельствовало о смерти Христа. В чашу вливается вино, смешанное с водой, изображая зримо слова Евангелия. Одновременно, обычай смешивания вина с водой, есть традиция античной культуры. Древние греки не пили вино в чистом виде, а для смешивания его с водой, использовалась специальная чаша – кратер. Этот обычай, был соблюден во время Тайной вечери Иисуса с учениками, что воспроизводится нынешней проскомидией.
Из остальных просфор, священник вынимает треугольные частицы, которые кладет на дискос. Из второй просфоры извлекается частица в честь пресвятой Богородицы, из третьей – частицы во имя Иоанна крестителя, пророков, апостолов, святителей, мучеников, преподобных, родителей Иисуса – Иоакима и Анны и все святых. На дискосе все частицы располагаются следующим образом: в центре находится агнец, слева от него – частица в честь Богородицы, справа – девять частиц из третьей просфоры, внизу – частицы из четвертой просфоры, за живущих людей, а из пятой – о умерших христианах. В современной церковной традиции, христиане, покупая просфоры и составляя записки, отдают первые и вторые в алтарь. Там записки о живых и умерших прочитываются, из просфор извлекаются частицы на дискос, в дополнение к частицам из четвертой и пятой просфор.
