Беловежские соглашения повлекли за собой образование ряда государств, объявивших о своей независимости в составе Содружества Независимых Государств (СНГ). Эти государства переживали сложный процесс внутренней трансформации в условиях явной нестабильности во всех сферах жизни. Де-юре став для России заграницей, многие из них фактически оставались тесно связанными с нею множеством экономических, культурных, этнических и иных вековых уз.
"Процесс суверенизации", охвативший бывшие республики СССР, сопровождался массовыми нарушениями некогда единой государственной границы, блокированием и пикетированием пограничных застав и КПП, физическими оскорблениями и обстрелами пограничных нарядов и целых подразделений пограничных войск. Начались противоправные акции, направленные на разрушение контролирующих сигнализационных систем на границе в Азербайджане и Армении, эстафета которых была подхвачена в Прибалтике и Молдавии.
И без того сложный процесс суверенизации в ряде бывших союзных республик стал сопровождаться острыми межнациональными конфликтами, борьбой за власть между различными группировками и кланами. Пограничные войска оказались в эпицентре вооруженных столкновений противоборствующих политических и этнических группировок, пытавшихся втянуть их в конфликты, каждая на своей стороне. Результатом этих устремлений стали открытые нападения на пограничные части и подразделения с целью захвата оружия, боеприпасов, военной техники и имущества.
Особо сложной на всем постсоветском пространстве была обстановка в Таджикистане, где борьба политических группировок за власть постепенно приняла характер полномасштабной гражданской войны. Предпосылками к ее развязыванию послужил ряд причин, важнейшими из которых были тяжелое экономическое положение в стране, клановое мировоззрение большей части населения, высокая степень его религиозности. Политика перестройки, начатая в Советском Союзе, уже тогда привела к возникновению исламско-демократического движения в Таджикской ССР. Костяк оппозиции составили Партия исламского возрождения (ИПВ), Демократическая партия Таджикистана (ДПТ) и ряд других движений.
Противостояние между бывшей коммунистической элитой и национально-демократическими и исламскими силами достаточно быстро перешло из политической сферы в этническо-клановую, приняв характер открытой вооруженной борьбы.
Обострившиеся внутриклановые распри крайне накалили обстановку на границе с Афганистаном, которую продолжали охранять российские пограничники.
