За плечами Сергея Романовича лежал огромный чекистский опыт, начавшийся с далекого 1921 года, когда он стал оперуполномоченным особого отдела Николаевской губернской ЧК. С 1924 года — курсант Высшей пограничной школы, после окончания которой возглавил оперативный отдел штаба погранвойск на румынской границе. До 1939 года служил в пограничных войсках. Одно время преподавал в пограничном училище. В 1940 году перешел на оперативную работу. В 1941 году — заместитель НКГБ УССР. С середины сентября 1941 года до начала января 1942 года фактически возглавлял НКВД Украины, поскольку нарком В. Т. Сергиенко, попав в окружение под Киевом, проявил трусость и был отстранен от исполнения служебных обязанностей.
Савченко полтора месяца инкогнито жил в оккупированном Харькове, а затем вышел в расположение советских войск. С 7 мая 1943 года по август 1949 года — нарком Государственной Безопасности (ГБ), а с марта министр ГБ УССР. Потом стал заместителем начальника разведывательного управления МГБ СССР. С сентября 1949 по январь 1953 года начальник советской внешней разведки, где получает звание генерал-лейтенанта. В ноябре 1951 года одновременно назначается заместителем МГБ СССР.
5 января 1953 года он освобожден от должности начальника внешней разведки, но до 11 марта оставался на должности заместителя министра.
В связи с тем, что в ходе реорганизации органов государственной безопасности, проведенной после смерти Сталина, МГБ влилось в МВД и внешняя разведка организационно стала Вторым Главным управлением МВД, 17 марта 1953 года Савченко назначается первым заместителем начальника внешней разведки.
В сентябре того же года переведен на должность начальника одного из управлений этого министерства.
Он награжден орденами Ленина (трижды), Красного Знамени (четырежды), Кутузова 2 ст., Богдана Хмельницкого 2 ст., Красной Звезды, а также медалями. Сергей Романович удостоен почетного ведомственного звания «Заслуженный работник НКВД».
В феврале 1955 года, в период хрущевской «прополки» старых кадров, уволен в запас с трактовкой в приказе — «по служебному несоответствию». Получалось, что вчера он успешно руководил внедрением нашей агентуры в стан противника, а сегодня он уже не соответствует этой должности. Такое было то время, не лучше оно и сегодня — каждый вождь тащит и расставляет своих не столько по уму, сколько по принципу верности, землячества и родства.
Он в конце сороковых и начале пятидесятых лично утверждал проведение основных разведывательных операций в США и в Великобритании. В 1955 году ушел на пенсию.
