Против архиепископа Иоанна фон Зинтена орден принял более действительные меры. Он сумел найти приверженцев среди его вассалов. В числе их были многие находившиеся из-за имущественных вопросов в натянутых отношениях к архиепископу или каноникам. Орден поддерживал этих вассалов; обременённых долгами, он ссужал крупными суммами, за что они закладывали у него свои имения, а других (например, Питкевер), которых за нарушение ленного права церковь хотела лишить их имений, он спасал от этой опасности. Когда в 1388 г. рыцарь Герман Икскюль заложил у ордена свой замок и обширные земельные владения, архиепископ подал в курию жалобу на орден. Орден был отлучён от церкви, но вследствие того нисколько не отказался от своих действий против архиепископа. Он имел в руках доказательства совершённой этим последним измены и вызвал владыку на суд собрания представителей от всех сословий. До открытия этого собрания, весной 1391 г. Иоанн фон Зинтен с частью каноников удалился за границу и искал помощи не только у курии, но и у короля Венцеля. Орден же завладел архиепископскими замками и сумел через своего представителя при курии подействовать на папу Бонифация IX, нуждавшегося в деньгах и возмущённого сношениями бежавшего архиепископа с германским королем. В ряде булл от осени 1393 г. до весны 1394 г. папа отменил все осудительные приговоры против ордена, назначил Иоанна фон Зинтена александрийским патриархом (т.е. лишил его всякого влияния), а Иоанна фон Валленродта (племянника великого магистра Конрада фон Валленродта) рижским архиепископом и разрешил ему вступить в Тевтонский орден. Папа даже издал такое распоряжение, чтобы никто в рижском архиепископстве не мог получить духовной должности, не сделавшись предварительно членом ордена, и чтобы капитул, как только большинство его каноников будет состоять из членов ордена, назывался капитулом не августианского, а Тевтонского ордена. Проведение этих распоряжений в жизнь привело бы к инкорпорации. Орден сделал, по-видимому, большой шаг вперёд на пути к единодержавию, к которому он стремился.
Но новый архиепископ не всеми был признан. Часть архиепископских вассалов, и во главе их восьмидесятилетний рыцарь Варфоломей фон Тизенгаузен, не хотели присягнуть и бежали к дерптскому епископу, тоже не желавшему присягнуть Иоанну фон Валленродту. Завязав сношения с бежавшими за границу рижскими канониками, он выставил в согласии с ними малолетнего принца Поммернштеттинского Оттона избранником архиепископства и заключил союзы со всем родом Оттона и с великим князем литовским Витовтом. Вместе с тем он приступил к обширным вооружениям и привлёк к себе многих, опасавшихся успехов ордена.
