Еще до начала войны на вооружение были приняты пять кораблей класса «Баттлстар» — «Коламбия», «Райкон», «Атлантиа», «Пегас» и «Галактика», способных нести на борту не только мощное вооружение, но и полностью укомплектованное подразделение космолетов-истребителей класса «Вайпер». С началом войны все «вайперы» подверглись полной модернизации и до конца войны оставались основной боевой единицей флота.
После начала боевых действий все «Баттлстар» были немедленно передислоцированы в места боевых действий, на Пайкон и Таурон, с целю обеспечить безопасное снабжение и доставку подкреплений на линию фронта. Несмотря на явное превосходство в космосе, Колониальный флот всегда был настороже из-за случайных атак сайлонов, которые появлялись как бы ниоткуда. Неспособный предсказать, когда и откуда в следующий раз появятся сайлонские рейдеры, Колониальный флот большую часть времени проводил в состоянии ожидания.
Ситуация осложнилась, когда налеты сайлонов начали происходить в районах, недосягаемых для их рейдеров. Эта загадка разрешилась в 128 году, когда радары впервые зафиксировали крупный боевой корабль сайлонов. «Атлантиа» сразу же была направлена на орбиту Таурона и доложила о первом столкновении с базовым кораблем сайлонов, массивным боевым кораблем, сравнимым по огневой мощи с «Атлантией».
Столкновение окончилось ничем и оба корабля, получив серьезные повреждения, были вынуждены ретироваться. Именно в этом бою Уиллиам Адама, будущий командир Галактики, получил боевое крещение и сбил своего первого сайлона. «Атлантия» с трудом доковыляла до доков Каприки, где и встала на трехмесячный ремонт.
Вскоре стал ясен масштаб сайлонской космической программы. Усовершенствованная радарная сеть и разведывательные полеты (из которых не вернулись многие пилоты) доказали существование по крайней мере трех полностью боеспособных базовых кораблей сайлонов, откуда и проводились рейды. Остальные восемь находились в разных стадиях завершения. Это тревожное сообщение заставило Правительство срочно изыскать фонды для строительства еще семи баттлстар, доведя их общее количество до двенадцати — «Пасифика», «Тритон», «Акрополис», «Солария», «Прометей», «Арго» и «Посейдон». «Пасифика» была закончена на верфях Геминиона в рекордно короткие сроки — полтора года.
В дополнение к базовым кораблям, сразу же после их обнаружения Колониальными силами, сайлоны начали вводить в действие обычные базы, обычно необитаемые, которые служили пунктами снабжения, докования и для исследовательских целей. Самая крупная из баз была обнаружена в поясе астероидов Дамокла, неподалеку от Таурона. Все попытки выбить сайлонов из пояса Дамокла потерпели неудачу.
