Конечно, стратегическое значение Снетогорского монастыря, с которым вступила в противоречие свободная жизнь его обитателей, было очень велико. Монастырь контролировал Великую со стороны Псковского озера. Его называли своеобразным замком, над которым поднимается дозорная вышка церкви под самые колокола. Не случайно ее надстроили, превратив в могучую вертикаль. Монастырь мог хорошо укрепиться, а в случае его захвата враги грозили самому Пскову.
В Смутное время, в 1611 году на Снятой горе Псков осаждали казаки, в 1615 году здесь находился лагерь шведского короля Густава-Адольфа, а в период восстания псковичей в 1650 году стоял отряд царских войск под командой Хованского.
Большой, красиво расположенный монастырь, служил преддверием Пскова. В сентябре 1472 года здесь вышла из речного судна племянница последнего византийского императора Софья – невеста великого князя Московского Ивана III, следовавшая из Рима в Москву. Бояре торжественно встретили ее на Теплом озере, где в 1240 году было Ледовое побоище. По пути в Псков Софья останавливалась «у Николы» в Устье, где отслужила молебен и ночевала. В Снетогорском монастыре после молебна в Рождественском соборе, Софья надела царские одежды, и отсюда торжественно въехала во Псков через Варлаамские ворота. Гостеприимные псковичи поднесли ей пятьдесят рублей, за что она обещала в случае необходимости заступаться за них перед великим князем.
В богатом и хорошо защищенном монастыре останавливался также и новгородский владыка – глава церковной жизни Пскова.
Исследователи архитектуры считают, что собор Снетогорского монастыря построен по образу и подобию псковского Мирожского собора. Но у этих памятников есть отличия, одни из которых проявились сразу, другие – со временем. Изменился строительный материал. Весь Снетогорский собор построен из местной известняковой плиты без добавления кирпича. Плитой псковичи пользовались до XVIII века. Снетогорский монастырь стройнее Мирожского. Его купол меньше, барабан выше. Верх получил украшение, напоминающее женское очелье со свисающими концами. Над ними идет полоса из небольших впадинок обычного в Пскове декора. Барабан повысили после 1492 года, когда в купол ударила молния. В узких, вытянутых окнах есть какая-то утонченность. И вместе с тем собор сохранил силу и достоинство. Особенно красив он со стороны спокойных и величественных апсид.
Фрески древних живописцев написаны свободно, с глубоким смыслом. Ангелы в вишневых нимбах, парящие на бархатисто-синем небе, трубят в золотые трубы. Над хорами два ангела разворачивают небесный свиток, усеянный звездами, похожими на цветы. К нему подняты огромные, печальные, словно наполненные слезами, глаза молодого пророка. По сторонам выстроились праведники.
