В знак особого расположения и величайшей чести, в Передней палате царь изредка принимал иностранных послов. Во время таких торжественных приемов палата украшалась дорогими коврами, золотым бархатом и ярким сукном. В XVII веке здесь висели осветительные приборы в виде золоченых буйволовых голов.
Третья комната – Престольная, Тронная или Кабинет царя. Стены расписаны золотом и красками в золотисто-красных тонах, покрыты изображениями святых и гербов областей России. В «красном углу» стоит царское кресло, обитое бархатом. В противоположном углу находится резной шкаф для посуды. Мебель обтянута малиновым бархатом. Убранство комнаты дополняет круглая изразцовая печь.
Северная стена имеет две двери, обитые красным сукном. Левая дверь ведет на винтовую лестницу, по которой можно подняться на пятый этаж, в так называемую «мыленку» и жилые покои. Правая дверь ведет в небольшую комнату, где помещался царский буфет и готовились кушанья. Эта комната интересна настенной росписью XVII века, расчищенной при реставрационных работах.
Престольная комната была самой недоступной из царских покоев. Лишь самые близкие к царю бояре, входили в нее «бить челом государю». Здесь царь угощал близких к нему бояр, иногда кормил нищих, юродивых и странников. Сюда к царю приводили пленных. В 1660 году в Престольной комнате происходил собор – церковный суд над патриархом Никоном, который обвинялся в церковном расколе. Собор единодушно лишил Никона патриаршего престола.
Среднее окно этой комнаты выделяется с улицы разными колонками, которые опираются на фигуры львов. Колонки перекрыты небольшим разрывным фронтоном художественной работы. В старину окно называлось Челобитным. Их него на двор опускался ящик, в который желающие могли опустить челобитную, то есть прошение. Оно попадало якобы прямо к царю, минуя приказы. На самом деле жалобы и прошения часто лежали в этом ящике очень долго, потому его и назвали долгим. До наших дней сохранилась поговорка: «положить дело в долгий ящик».
Четвертой комнатой была Опочивальня. В центре ее стоит деревянная резная кровать с балдахином. Мебель обита венецианским бархатом. На стенах в четырех медальонах изображены иконы – «Рождество Христово», «Рождество Богородицы» и др. В углу – изразцовая расписная печь с лежанкой.
Пятая комната – Молельня. Молельня расписана изображениями святых. В резных золоченых киотах расположены иконы и кресты XVII века. Перед киотом находится небольшой аналой для богослужебной книги.
